256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2940 on replicon NC_010715
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 75 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  30.86 
 
 		 368 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  40.98 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2246  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2643  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  40.38 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  37.04 
 
 		 383 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4304  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 304 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.38 
 
 		 377 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4072  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 380 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 277 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  40.43 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  35.85 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  35.85 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1604  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  32.08 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 806 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  42 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  32.08 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>