90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4232 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  100 
 
 		 170 aa  336  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0900  hypothetical protein  63.27 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0458  hypothetical protein  46.71 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  47.88 
 
 		 143 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0447  thioredoxin-related  73.08 
 
 		 146 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4352  Thioredoxin domain protein  66.29 
 
 		 112 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6171  thioredoxin domain-containing protein  67.44 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4643  thioredoxin  54.32 
 
 		 120 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3032  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18680  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194491  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1559  putative thioredoxin  55.91 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.832345  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4375  hypothetical protein  51.9 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37690  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  41.57 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2110  putative thioredoxin  33.97 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0349096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3354  glutaredoxin  44.87 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0202302  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  27.71 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  34.57 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  35.62 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  35.62 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  35.62 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6826  hypothetical protein  35.56 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10831  thioredoxin thiX  31.76 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  43.24 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  32.1 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.07 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  28.24 
 
 		 98 aa  49.3  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  32.14 
 
 		 102 aa  48.9  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  28.75 
 
 		 106 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 		 103 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 		 103 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  28.77 
 
 		 104 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  25.56 
 
 		 102 aa  46.6  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  28.87 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  31.71 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  31.71 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  30.59 
 
 		 117 aa  45.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  25 
 
 		 103 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  30.59 
 
 		 104 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0908  redox-active disulfide protein 1  36.36 
 
 		 80 aa  44.7  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  27.17 
 
 		 106 aa  44.3  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  30.68 
 
 		 105 aa  44.3  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  37.35 
 
 		 108 aa  44.3  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  31.33 
 
 		 105 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  33.66 
 
 		 110 aa  44.3  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  31.46 
 
 		 106 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  32.99 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  32.86 
 
 		 105 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  29.59 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  28 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  28.57 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  23.75 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  26.25 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  31.65 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  29.9 
 
 		 106 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1773  redox-active disulfide protein 1  32.47 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  25.97 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  35.21 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  32.26 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  23.29 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  34.29 
 
 		 88 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  33.78 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1036  redox-active disulfide protein 1  35.06 
 
 		 80 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  31.11 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl178  thioredoxin  26.51 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  29.9 
 
 		 105 aa  43.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  29.63 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  27.55 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0261  thioredoxin, putative  29.63 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689046 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1262  Thioredoxin domain  29.81 
 
 		 128 aa  42.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000573175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  26.97 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  42  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  26.25 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  25 
 
 		 104 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  25.93 
 
 		 88 aa  41.6  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  32.18 
 
 		 110 aa  41.6  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  28.57 
 
 		 421 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  32 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  34.15 
 
 		 105 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.05 
 
 		 108 aa  41.6  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  28.12 
 
 		 106 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  28.95 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  29.63 
 
 		 107 aa  41.2  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  31.82 
 
 		 122 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  25.3 
 
 		 108 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  30.49 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  28.42 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  26.25 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>