More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4075 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 		 484 aa  969    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  54.91 
 
 		 476 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  43.07 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.14 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  30.15 
 
 		 589 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.44 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.97 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.29 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.28 
 
 		 596 aa  140  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.09 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  28.84 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.15 
 
 		 583 aa  136  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  30.56 
 
 		 631 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.29 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  28.32 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.91 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  30.4 
 
 		 591 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.3 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.770057 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.84 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  28.36 
 
 		 596 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  29.94 
 
 		 925 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  29.72 
 
 		 596 aa  127  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.4 
 
 		 598 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  29.41 
 
 		 596 aa  126  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.72 
 
 		 584 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.98 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  29.92 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  26.17 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  29.06 
 
 		 596 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  29.39 
 
 		 507 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  29.07 
 
 		 609 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  29.53 
 
 		 605 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.44 
 
 		 589 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28.99 
 
 		 598 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.92 
 
 		 596 aa  123  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  29.31 
 
 		 483 aa  123  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  28.98 
 
 		 623 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.62 
 
 		 591 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  29.92 
 
 		 596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  30.04 
 
 		 925 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.83 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.92 
 
 		 596 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  26.95 
 
 		 637 aa  121  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.1 
 
 		 596 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.1 
 
 		 596 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.1 
 
 		 596 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.1 
 
 		 596 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.14 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  28.63 
 
 		 926 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.8 
 
 		 1005 aa  118  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  26.68 
 
 		 511 aa  118  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.67 
 
 		 529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.9 
 
 		 523 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.88 
 
 		 593 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  28.18 
 
 		 635 aa  117  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  28.4 
 
 		 599 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.51 
 
 		 596 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  26.88 
 
 		 650 aa  116  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  25.54 
 
 		 715 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1072  flavoprotein  27.91 
 
 		 598 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.208394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  26.74 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.85 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.83 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.57 
 
 		 597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.71 
 
 		 555 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  26.69 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  24.6 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.5 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  28.26 
 
 		 1004 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  25.39 
 
 		 517 aa  111  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.15 
 
 		 519 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.06 
 
 		 543 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.18 
 
 		 576 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.86 
 
 		 566 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  27.79 
 
 		 510 aa  110  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0172  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.46 
 
 		 560 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.79854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.68 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.68 
 
 		 616 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  24.8 
 
 		 507 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.38 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07260  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.74 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  27.53 
 
 		 957 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  29.56 
 
 		 561 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0183  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.56 
 
 		 592 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  26.81 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.96 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3732  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.13 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  29.03 
 
 		 506 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  27.83 
 
 		 616 aa  107  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  26.22 
 
 		 519 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.26 
 
 		 515 aa  106  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.23 
 
 		 557 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  27.29 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.35 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2605  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.92 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.800932  normal  0.0451497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  26.79 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2704  putative FAD-binding dehydrogenase  35.19 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.900801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  26.53 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  27.22 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  27.08 
 
 		 519 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>