More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3027 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  100 
 
 
260 aa  494  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.5 
 
 
268 aa  274  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.98 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.51 
 
 
269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.49 
 
 
317 aa  271  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.38 
 
 
269 aa  271  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.92 
 
 
274 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.09 
 
 
274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  61.26 
 
 
270 aa  269  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.26 
 
 
270 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.57 
 
 
272 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.51 
 
 
269 aa  261  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  62.25 
 
 
273 aa  258  8e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.89 
 
 
271 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.54 
 
 
274 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.9 
 
 
268 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.57 
 
 
272 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.57 
 
 
272 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.57 
 
 
272 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.97 
 
 
272 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.31 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.13 
 
 
275 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.09 
 
 
272 aa  251  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.8 
 
 
267 aa  251  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.1 
 
 
268 aa  249  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.96 
 
 
286 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.52 
 
 
287 aa  248  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.33 
 
 
269 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.87 
 
 
270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.17 
 
 
272 aa  244  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.51 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.94 
 
 
272 aa  242  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.38 
 
 
282 aa  242  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.35 
 
 
273 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.04 
 
 
268 aa  231  8.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.66 
 
 
277 aa  229  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.74 
 
 
270 aa  201  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.85 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  46.3 
 
 
288 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.79 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.91 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.95 
 
 
269 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.02 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.81 
 
 
265 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.29 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.98 
 
 
271 aa  195  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.86 
 
 
268 aa  194  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.62 
 
 
266 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.91 
 
 
285 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.67 
 
 
258 aa  193  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.51 
 
 
285 aa  191  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.51 
 
 
285 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.02 
 
 
270 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.51 
 
 
285 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.96 
 
 
265 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.97 
 
 
266 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.69 
 
 
262 aa  190  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 
263 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.75 
 
 
278 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.36 
 
 
287 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.53 
 
 
265 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.52 
 
 
271 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.26 
 
 
268 aa  188  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.83 
 
 
268 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.45 
 
 
268 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
268 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.28 
 
 
257 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.12 
 
 
266 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.51 
 
 
265 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.4 
 
 
278 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.89 
 
 
273 aa  184  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.31 
 
 
269 aa  184  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.75 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.42 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.8 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.63 
 
 
262 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 
264 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.28 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.66 
 
 
262 aa  181  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.36 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.88 
 
 
271 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
264 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.49 
 
 
270 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
264 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.93 
 
 
259 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
279 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  42.41 
 
 
259 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.77 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.6 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.1 
 
 
281 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.65 
 
 
273 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.37 
 
 
263 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.95 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.53 
 
 
270 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.11 
 
 
272 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.57 
 
 
263 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>