More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0642 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 		 831 aa  670    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  47.25 
 
 		 817 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  47.91 
 
 		 815 aa  763    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  45.38 
 
 		 825 aa  690    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  43 
 
 		 816 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 		 812 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  44.43 
 
 		 831 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  44.46 
 
 		 827 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  45.64 
 
 		 819 aa  704    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  49.51 
 
 		 815 aa  796    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 815 aa  1659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 827 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  51.98 
 
 		 843 aa  823    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  45.82 
 
 		 823 aa  715    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  42.87 
 
 		 816 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  41.73 
 
 		 854 aa  600  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  42.97 
 
 		 826 aa  595  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 799 aa  515  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  36.8 
 
 		 822 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  34.86 
 
 		 819 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 835 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  33.33 
 
 		 879 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 816 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 806 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 		 806 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 835 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 837 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 806 aa  415  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.82 
 
 		 821 aa  412  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 815 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 812 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 804 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 805 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 835 aa  405  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  32.77 
 
 		 831 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 802 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 831 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  32.57 
 
 		 831 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  33.04 
 
 		 831 aa  389  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.2 
 
 		 830 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 830 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 830 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 830 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 830 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 816 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  31.94 
 
 		 808 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  30.99 
 
 		 948 aa  357  6.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.12 
 
 		 838 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 821 aa  345  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.23 
 
 		 857 aa  342  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.98 
 
 		 850 aa  333  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 801 aa  294  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 797 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.64 
 
 		 840 aa  283  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 853 aa  265  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 853 aa  262  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 853 aa  262  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 853 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.85 
 
 		 360 aa  181  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.87 
 
 		 441 aa  180  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  33.67 
 
 		 371 aa  178  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  31.2 
 
 		 357 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  32.98 
 
 		 442 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  32.98 
 
 		 440 aa  174  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.3 
 
 		 360 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.89 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.3 
 
 		 360 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.94 
 
 		 963 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.31 
 
 		 364 aa  167  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.93 
 
 		 988 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  32.04 
 
 		 360 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  31.25 
 
 		 364 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.3 
 
 		 368 aa  165  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.83 
 
 		 364 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.57 
 
 		 364 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  33.08 
 
 		 370 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.69 
 
 		 995 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  30.05 
 
 		 371 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  30.9 
 
 		 366 aa  162  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.88 
 
 		 366 aa  160  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 385 aa  160  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 385 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.81 
 
 		 366 aa  159  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.81 
 
 		 366 aa  159  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.12 
 
 		 967 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.81 
 
 		 366 aa  159  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.81 
 
 		 366 aa  159  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.01 
 
 		 366 aa  159  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 385 aa  158  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.72 
 
 		 366 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.81 
 
 		 366 aa  157  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.16 
 
 		 372 aa  157  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.52 
 
 		 366 aa  157  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.56 
 
 		 995 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.72 
 
 		 364 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.52 
 
 		 366 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.05 
 
 		 995 aa  156  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 390 aa  155  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.1 
 
 		 369 aa  155  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.81 
 
 		 366 aa  154  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>