272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0114 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0114  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
483 aa  999    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  45.53 
 
 
498 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2005  putative cytochrome c peroxidase  44.85 
 
 
451 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2749  putative cytochrome c peroxidase  45.31 
 
 
437 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0452779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  47.8 
 
 
435 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  44.63 
 
 
449 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0540  di-haem cytochrome c peroxidase  36.26 
 
 
499 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  33.72 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  30.05 
 
 
768 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.82 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  33.73 
 
 
346 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  32.33 
 
 
346 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  31.36 
 
 
346 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  30.47 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  33.63 
 
 
347 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  27.99 
 
 
384 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  30.93 
 
 
336 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  30.5 
 
 
334 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  33.33 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  32.48 
 
 
358 aa  134  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  29.71 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  31.94 
 
 
346 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 
328 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  30.03 
 
 
431 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  29.58 
 
 
626 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  29.86 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  31.79 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  30.1 
 
 
311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  30.49 
 
 
626 aa  128  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  33.12 
 
 
345 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  30.51 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  30.03 
 
 
337 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  29.43 
 
 
335 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  30.75 
 
 
343 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  31.53 
 
 
348 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  29.52 
 
 
346 aa  124  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  30.21 
 
 
322 aa  124  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  31.03 
 
 
360 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  32.81 
 
 
340 aa  124  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  30.99 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  28.28 
 
 
369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  30.48 
 
 
333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  31.09 
 
 
359 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  29.3 
 
 
379 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  31.76 
 
 
473 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  26.65 
 
 
395 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  30.32 
 
 
365 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  29.61 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  26.8 
 
 
302 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  30.94 
 
 
521 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  26.94 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  29.38 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  30.41 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  27.66 
 
 
383 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  29.95 
 
 
365 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 
346 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  30.77 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  29.43 
 
 
594 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  29.43 
 
 
304 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  27.75 
 
 
390 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  29.43 
 
 
304 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  29.55 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  29.11 
 
 
459 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  27.6 
 
 
345 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  29.11 
 
 
459 aa  114  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  29.11 
 
 
459 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  27.3 
 
 
346 aa  113  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  30.06 
 
 
607 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  28.41 
 
 
352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  27.56 
 
 
346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  29.28 
 
 
348 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  30.43 
 
 
365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  30.09 
 
 
616 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  29.85 
 
 
358 aa  109  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  29.55 
 
 
314 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04385  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.02 
 
 
447 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  27.44 
 
 
377 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  30.38 
 
 
324 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  28.97 
 
 
351 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  29.07 
 
 
330 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  29 
 
 
328 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  27.86 
 
 
398 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
427 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  28.9 
 
 
465 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  28.9 
 
 
465 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  28.9 
 
 
465 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  28.14 
 
 
401 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  27.27 
 
 
598 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  27.8 
 
 
437 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  28.88 
 
 
466 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  28.88 
 
 
466 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  28.88 
 
 
466 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2697  cytochrome c peroxidase  30.72 
 
 
357 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  28.83 
 
 
368 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  28.88 
 
 
466 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  28.9 
 
 
465 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  28.88 
 
 
466 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.9 
 
 
465 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.9 
 
 
465 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>