More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1523 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  51.03 
 
 
714 aa  706    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
717 aa  1454    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  45.88 
 
 
714 aa  658    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  44.08 
 
 
735 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  43.18 
 
 
714 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  42.57 
 
 
746 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  42.98 
 
 
739 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  43.13 
 
 
739 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  41.61 
 
 
732 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  41.89 
 
 
732 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  41.89 
 
 
732 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  40 
 
 
735 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  44.11 
 
 
728 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  44.11 
 
 
728 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.26 
 
 
713 aa  501  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.12 
 
 
701 aa  492  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  38.52 
 
 
724 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  37.82 
 
 
803 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  32.74 
 
 
730 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.59 
 
 
502 aa  361  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  40.47 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  42.12 
 
 
483 aa  350  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  31.54 
 
 
720 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  41.54 
 
 
518 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  40.72 
 
 
491 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  41.21 
 
 
498 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  40.82 
 
 
483 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.36 
 
 
474 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  29.96 
 
 
738 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  42.17 
 
 
504 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  42.31 
 
 
478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  39.57 
 
 
512 aa  332  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.53 
 
 
521 aa  332  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  39.49 
 
 
525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.55 
 
 
504 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.61 
 
 
498 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  38.59 
 
 
572 aa  306  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  39.66 
 
 
482 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  37.95 
 
 
504 aa  301  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.33 
 
 
514 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  37.45 
 
 
510 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.54 
 
 
503 aa  276  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  35.24 
 
 
517 aa  276  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.77 
 
 
507 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.53 
 
 
507 aa  247  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  38.97 
 
 
515 aa  227  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.21 
 
 
513 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.34 
 
 
517 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  36.32 
 
 
252 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  30.97 
 
 
232 aa  134  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  29.85 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  35.87 
 
 
226 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  33.02 
 
 
236 aa  93.6  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  24.02 
 
 
1522 aa  92.4  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  29.8 
 
 
533 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  30.63 
 
 
246 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 
472 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
240 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  34.01 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  30.99 
 
 
225 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.91 
 
 
465 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  37.6 
 
 
217 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  26.62 
 
 
1821 aa  82.4  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 
224 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  36.8 
 
 
217 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  31.2 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  29.07 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.2 
 
 
546 aa  80.5  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  29.64 
 
 
524 aa  80.5  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  25.18 
 
 
1783 aa  79  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  29.7 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.53 
 
 
533 aa  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  30.16 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  28.34 
 
 
206 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  30.08 
 
 
236 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  30.83 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  34.88 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  30.08 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.08 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  30.08 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  30.08 
 
 
236 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  30.08 
 
 
236 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  30.08 
 
 
192 aa  73.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.27 
 
 
497 aa  73.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  30.08 
 
 
236 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  27.93 
 
 
224 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  30.3 
 
 
197 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  27.37 
 
 
224 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  25.35 
 
 
623 aa  72  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  29.7 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  29.7 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  34.38 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>