More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0726 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  100 
 
 		 574 aa  1178    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0269  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.31 
 
 		 585 aa  212  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542265 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  28.48 
 
 		 906 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4467  SNF2-related  29.42 
 
 		 582 aa  196  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 		 1104 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  29.47 
 
 		 1086 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  29.9 
 
 		 924 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  29.37 
 
 		 726 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.37 
 
 		 1067 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  30.31 
 
 		 1185 aa  183  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 933 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 		 617 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 		 925 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 1091 aa  177  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  28.81 
 
 		 621 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  31.36 
 
 		 1068 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  28.93 
 
 		 1082 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 1082 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  28.78 
 
 		 1134 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  28.72 
 
 		 1082 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  28.72 
 
 		 1082 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  27.25 
 
 		 1175 aa  174  5.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  32.8 
 
 		 1068 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  28.41 
 
 		 1178 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  28.2 
 
 		 1362 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  29.05 
 
 		 1091 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  29.74 
 
 		 1100 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 1069 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  30.94 
 
 		 1071 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  30 
 
 		 1088 aa  171  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  26.48 
 
 		 777 aa  170  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 1007 aa  170  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  27.37 
 
 		 1150 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  27.65 
 
 		 1113 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 1113 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  29.56 
 
 		 918 aa  169  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  29.31 
 
 		 918 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1088 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  28.66 
 
 		 1386 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 		 918 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  27.87 
 
 		 1007 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  27.35 
 
 		 903 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 1155 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  28.36 
 
 		 980 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1128 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  26.99 
 
 		 949 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 1449 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  28.06 
 
 		 1078 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  28.6 
 
 		 1070 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  29.27 
 
 		 1080 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 1048 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 1112 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  27.22 
 
 		 1159 aa  167  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  28.78 
 
 		 1070 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  29.08 
 
 		 918 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  29.08 
 
 		 918 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  29.05 
 
 		 1065 aa  166  9e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  29.08 
 
 		 918 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  28.57 
 
 		 1031 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 898 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  28.69 
 
 		 1354 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 		 1152 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  28.86 
 
 		 918 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 1047 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 1112 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4415  helicase domain protein  29.21 
 
 		 762 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.872942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  28.86 
 
 		 918 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  28.73 
 
 		 1209 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  28.78 
 
 		 1047 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 895 aa  164  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 		 1403 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  27.78 
 
 		 1063 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  28.85 
 
 		 918 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  27.46 
 
 		 1048 aa  164  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  28.63 
 
 		 1084 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  26.32 
 
 		 991 aa  164  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.6 
 
 		 1072 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  28.46 
 
 		 1125 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  28.67 
 
 		 918 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  26.75 
 
 		 1025 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  28.81 
 
 		 1088 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.41 
 
 		 988 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 		 918 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  26.6 
 
 		 663 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  26.75 
 
 		 1381 aa  160  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 1068 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  26.61 
 
 		 1006 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  26.95 
 
 		 638 aa  160  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  29.19 
 
 		 1437 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  28.6 
 
 		 1084 aa  160  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  28.8 
 
 		 1112 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  29.06 
 
 		 1126 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.8 
 
 		 1082 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 1073 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  26 
 
 		 773 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  26.79 
 
 		 1019 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  25.84 
 
 		 886 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 		 1073 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 		 1029 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 		 1171 aa  158  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>