202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1923 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1923  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  100 
 
 
379 aa  764    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  38.76 
 
 
392 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  33.42 
 
 
385 aa  192  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  32.23 
 
 
397 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 
372 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
423 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  33.22 
 
 
345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  32.44 
 
 
363 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  27.11 
 
 
344 aa  142  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  30.46 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
340 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.44 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
382 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
333 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  26.32 
 
 
343 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  25.62 
 
 
341 aa  108  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
352 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
355 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
335 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  25.6 
 
 
346 aa  106  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  26.14 
 
 
335 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
336 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  25.84 
 
 
335 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
346 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
336 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
347 aa  102  8e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
365 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  25.09 
 
 
335 aa  102  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
341 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
347 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
365 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
338 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
339 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  24.25 
 
 
374 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 
340 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
342 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
349 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
342 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
342 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 
343 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  25 
 
 
339 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 
353 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  25 
 
 
339 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
337 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  25.59 
 
 
344 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
372 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
339 aa  97.1  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 
328 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  24.56 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  26.46 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.6 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
345 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  25.36 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25.63 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
334 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.94 
 
 
335 aa  94  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
338 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
337 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  24.74 
 
 
335 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 
338 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
336 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  23.83 
 
 
333 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
341 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.54 
 
 
336 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 
355 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 
351 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  24.65 
 
 
338 aa  86.3  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  22.92 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  24.83 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  21.2 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  24.83 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>