More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3064 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3064  aminotransferase class-III  100 
 
 
435 aa  884    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5404  aminotransferase class-III  55.45 
 
 
435 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254649  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2631  aminotransferase class-III  53.11 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.445972  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1190  aminotransferase class-III  51.99 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4579  aminotransferase class-III  47.56 
 
 
408 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2295  aminotransferase class-III  48.8 
 
 
422 aa  359  5e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1812  aminotransferase class-III  44.95 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2226  aminotransferase class-III  46.15 
 
 
414 aa  332  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  38.82 
 
 
460 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  39.86 
 
 
471 aa  309  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  43.16 
 
 
456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  38.58 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  38.61 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  38.55 
 
 
459 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  37.82 
 
 
455 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  39.41 
 
 
446 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  39.41 
 
 
446 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  39.41 
 
 
446 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  39.41 
 
 
446 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  39.27 
 
 
449 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  39.27 
 
 
449 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  39.27 
 
 
449 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  39.27 
 
 
449 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  39.27 
 
 
449 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  39.18 
 
 
446 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  39.27 
 
 
449 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  39.27 
 
 
449 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  39.27 
 
 
449 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  38.46 
 
 
464 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  37.17 
 
 
452 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  38.95 
 
 
446 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  36.95 
 
 
452 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  37.17 
 
 
452 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  36.84 
 
 
454 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.78 
 
 
453 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.55 
 
 
456 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  40.71 
 
 
466 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.55 
 
 
456 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  39.33 
 
 
459 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  38.5 
 
 
446 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.94 
 
 
457 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.59 
 
 
443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  40.6 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  37.97 
 
 
478 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  39.68 
 
 
455 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  36.01 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.96 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  40.64 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  37.1 
 
 
453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  36.85 
 
 
453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.21 
 
 
453 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  38.78 
 
 
458 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  36.47 
 
 
470 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0351  putative aminotransferase  38.74 
 
 
478 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000167331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  36.55 
 
 
456 aa  279  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  36.81 
 
 
455 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38.22 
 
 
454 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2863  putative aminotransferase  37.63 
 
 
465 aa  277  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.221703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  38.44 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  38.04 
 
 
470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.53 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  37.76 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  39.28 
 
 
451 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  38.04 
 
 
470 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0824  putative aminotransferase  38.33 
 
 
465 aa  273  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  38.04 
 
 
470 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  38.07 
 
 
480 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  38.13 
 
 
480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  37.84 
 
 
480 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  37.84 
 
 
480 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  38.29 
 
 
463 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  37.53 
 
 
468 aa  269  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  37.67 
 
 
477 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  37.56 
 
 
462 aa  269  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  37.9 
 
 
475 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  37.53 
 
 
465 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  37.9 
 
 
464 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  37.9 
 
 
464 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  37.9 
 
 
464 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  37.44 
 
 
461 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  36.12 
 
 
482 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  37.19 
 
 
461 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  37.19 
 
 
448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  36.34 
 
 
481 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  37.18 
 
 
460 aa  266  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  37.39 
 
 
477 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  37.27 
 
 
463 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  36.7 
 
 
458 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  35.03 
 
 
467 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  37.13 
 
 
448 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  37.13 
 
 
448 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  37.13 
 
 
448 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  36.57 
 
 
458 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  37.21 
 
 
461 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  35.67 
 
 
449 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  36.1 
 
 
454 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  36.12 
 
 
457 aa  262  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  37.2 
 
 
451 aa  262  8e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  36.4 
 
 
460 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  36.99 
 
 
472 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>