More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1979 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
129 aa  249  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  55.97 
 
 
142 aa  120  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  51.49 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  48.51 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 
140 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  48.44 
 
 
142 aa  100  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  46.21 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  52.04 
 
 
137 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  46.15 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  52.04 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  45.69 
 
 
163 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  42.86 
 
 
148 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  46.9 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  41.22 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  43.14 
 
 
156 aa  84  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  41.51 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  36.73 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  37.61 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  34.78 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  36.7 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2290  HSP20 family protein  35.87 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.581771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2372  heat shock protein, Hsp20 family  35.87 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0601479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  36.28 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  38 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2043  heat shock protein  35.87 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7013  hypothetical protein  47.14 
 
 
253 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00663505  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2106  HSP20 family protein  35.87 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2045  heat shock protein  35.87 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00409698  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2262  HSP20 family protein  35.87 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.378643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2287  heat shock protein, Hsp20 family  35.87 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.58706e-24 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  35.19 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2242  heat shock protein, Hsp20 family  31.68 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00889609  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  30.17 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  36.52 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  36.94 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  35.42 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  36 
 
 
195 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  35.96 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19940  molecular chaperone (small heat shock protein)  40 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.618399  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  39 
 
 
151 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  30.1 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  30.1 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  30.1 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  32.69 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  30.1 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  36.75 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  30.1 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  30.1 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  31.68 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  30.1 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  31.71 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  36.46 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  39.8 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.29 
 
 
260 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  32.97 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  34 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  35.23 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  35.35 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
151 aa  57.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  31.31 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  31.07 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
138 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  25 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  29.66 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>