More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4682 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4682  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 609 aa  1219    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13890  glycosidase  52.68 
 
 		 624 aa  631  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1524  alpha amylase catalytic region  46.06 
 
 		 634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2159  alpha amylase catalytic region  50.79 
 
 		 647 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3328  maltodextrin glucosidase  52.08 
 
 		 596 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0747  alpha amylase, catalytic region  46.17 
 
 		 655 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.29476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2294  alpha amylase catalytic region  46.22 
 
 		 611 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0938  maltodextrin glucosidase  47.23 
 
 		 590 aa  465  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  46.71 
 
 		 569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  34.86 
 
 		 617 aa  359  7e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  38.05 
 
 		 614 aa  355  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  34.3 
 
 		 605 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  34.3 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  34.3 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  34.3 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  34.3 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  34.3 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  34.76 
 
 		 604 aa  273  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  33.84 
 
 		 605 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  35.86 
 
 		 605 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  35.62 
 
 		 605 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  35.62 
 
 		 605 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  35.83 
 
 		 605 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  33.33 
 
 		 605 aa  263  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  31.02 
 
 		 608 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  31.95 
 
 		 607 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  31.57 
 
 		 609 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  31.57 
 
 		 609 aa  253  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  32.25 
 
 		 608 aa  246  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  32.39 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  35.4 
 
 		 481 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  30.39 
 
 		 580 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  33.73 
 
 		 481 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  31.71 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  34 
 
 		 496 aa  212  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  31.8 
 
 		 484 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  29.18 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  32.63 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  32.43 
 
 		 588 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  32.33 
 
 		 486 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1265  alpha amylase catalytic region  29.09 
 
 		 463 aa  198  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  31.18 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  31.18 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  29.44 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  30.22 
 
 		 481 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  31.92 
 
 		 487 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  30.73 
 
 		 589 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  29.63 
 
 		 586 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  29.91 
 
 		 486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  32.2 
 
 		 587 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  27.34 
 
 		 576 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  28.02 
 
 		 582 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  25.4 
 
 		 659 aa  182  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 474 aa  181  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  29.17 
 
 		 1847 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  29.61 
 
 		 475 aa  179  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  27.82 
 
 		 586 aa  178  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  27.82 
 
 		 586 aa  177  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  27.82 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  27.62 
 
 		 586 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  28.23 
 
 		 586 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  27.62 
 
 		 586 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  27.62 
 
 		 586 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  27.62 
 
 		 586 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  27.62 
 
 		 586 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  27.62 
 
 		 586 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3281  maltodextrin glucosidase  33.51 
 
 		 414 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122809 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  28.54 
 
 		 584 aa  171  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 574 aa  169  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  28.99 
 
 		 575 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  32.13 
 
 		 481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  24.91 
 
 		 583 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  25.9 
 
 		 663 aa  166  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  31.98 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  29.81 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  27.64 
 
 		 479 aa  166  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  25.26 
 
 		 606 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 589 aa  161  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  31.9 
 
 		 1307 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  30.27 
 
 		 472 aa  161  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.51 
 
 		 610 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  29.18 
 
 		 578 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  26.36 
 
 		 610 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  30.51 
 
 		 715 aa  156  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  31.18 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  28.69 
 
 		 1145 aa  152  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  26.28 
 
 		 1643 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  27.33 
 
 		 1753 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  28.94 
 
 		 1401 aa  150  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  26.89 
 
 		 574 aa  148  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  25.39 
 
 		 1175 aa  148  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17020  glycosidase  29.33 
 
 		 727 aa  147  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  27.55 
 
 		 644 aa  147  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  24.66 
 
 		 651 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  27.72 
 
 		 1401 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2874  alpha amylase catalytic region  25.04 
 
 		 1299 aa  144  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  24.47 
 
 		 1193 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  30.65 
 
 		 635 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>