124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4470 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 493 aa  938    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  33.65 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  29.65 
 
 		 507 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 		 503 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 488 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  26.91 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  28.68 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  29.14 
 
 		 508 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  28.68 
 
 		 503 aa  113  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  29.31 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  30.93 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  27.12 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 509 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 487 aa  99.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 503 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 494 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 479 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  30.21 
 
 		 510 aa  97.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  30.21 
 
 		 510 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 502 aa  97.1  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  24.21 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  24.21 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 520 aa  91.3  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  26.42 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  25.17 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  25.05 
 
 		 492 aa  87  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  26.76 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.13 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  25.47 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.45 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  30.11 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  29.81 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  26.48 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.45 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  27.21 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.01 
 
 		 502 aa  77  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 501 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.39 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.55 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.7 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.39 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.39 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.39 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.39 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.39 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.22 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.78 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.78 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.78 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.78 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.78 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  30.65 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  24.5 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  27.24 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  23.95 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2291  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00691  hypothetical protein  21.04 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  25.67 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  29.87 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 		 490 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>