154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1798 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1798  UspA domain protein  100 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.104152  normal  0.0257832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1638  UspA domain protein  38.17 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170116  normal  0.0161914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  35.82 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.73 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  38.58 
 
 		 303 aa  67.4  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 275 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  31.91 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  38.69 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  36.57 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.67 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3045  hypothetical protein  37.86 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  31.39 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  33.58 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  35.07 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  32.37 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.82 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1902  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156681  normal  0.317587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.66 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  33.58 
 
 		 373 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  35.61 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 275 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 284 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  33.1 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 291 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 293 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 296 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  36.67 
 
 		 302 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  31.37 
 
 		 294 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.74 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  32.3 
 
 		 293 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  32.3 
 
 		 293 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 296 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.59 
 
 		 288 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  31.68 
 
 		 293 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 293 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  36.5 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.21 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.56 
 
 		 321 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 290 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  34.23 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.65 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  30.28 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.86 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  26.39 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.86 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  31.01 
 
 		 305 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  31.65 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.1 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.37 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0997  UspA domain-containing protein  30.16 
 
 		 306 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975908  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  31.34 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  34.06 
 
 		 308 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 294 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  33.08 
 
 		 307 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  30.99 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  30.66 
 
 		 298 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 298 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 298 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  30.6 
 
 		 305 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  35.29 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.35 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  30.34 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  31.25 
 
 		 299 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  35.77 
 
 		 313 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  27.98 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.53 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 		 295 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  28.89 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 296 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  29.93 
 
 		 347 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  30.28 
 
 		 297 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 		 289 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  30.2 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 297 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32.85 
 
 		 291 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  30.91 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 		 274 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>