More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1429 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.41 
 
 		 1257 aa  1272    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  47.52 
 
 		 1264 aa  974    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  56.69 
 
 		 1436 aa  656    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  45.09 
 
 		 1230 aa  840    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  54.06 
 
 		 1522 aa  1196    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  41.93 
 
 		 1218 aa  853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  54.13 
 
 		 1321 aa  1155    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  41.69 
 
 		 1218 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  100 
 
 		 1284 aa  2499    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  41.85 
 
 		 1218 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  53.71 
 
 		 1231 aa  1014    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  41.85 
 
 		 1218 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  52.2 
 
 		 1218 aa  1034    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  41.85 
 
 		 1218 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 1332 aa  959    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  53.39 
 
 		 1301 aa  1095    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  48.94 
 
 		 1194 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.51 
 
 		 1179 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  44.42 
 
 		 581 aa  396  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  28.03 
 
 		 1343 aa  390  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.41 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  41.54 
 
 		 636 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  39.37 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  39.37 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  39.37 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.56 
 
 		 597 aa  372  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  39.22 
 
 		 592 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.54 
 
 		 608 aa  367  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  41.5 
 
 		 614 aa  365  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 614 aa  363  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  39.79 
 
 		 619 aa  361  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38 
 
 		 556 aa  359  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.23 
 
 		 611 aa  357  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  36.9 
 
 		 637 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  38.83 
 
 		 609 aa  353  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  39.17 
 
 		 610 aa  353  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  36.54 
 
 		 622 aa  353  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.38 
 
 		 617 aa  352  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 600 aa  350  9e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  33.28 
 
 		 598 aa  350  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 607 aa  350  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  35.32 
 
 		 635 aa  348  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  35.05 
 
 		 588 aa  347  8.999999999999999e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.08 
 
 		 587 aa  347  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.54 
 
 		 580 aa  345  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.27 
 
 		 614 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.9 
 
 		 601 aa  345  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.13 
 
 		 581 aa  343  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 		 606 aa  342  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  37.09 
 
 		 602 aa  341  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  33.63 
 
 		 608 aa  340  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  34.92 
 
 		 603 aa  340  8e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.48 
 
 		 601 aa  340  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  39.08 
 
 		 605 aa  340  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  37.35 
 
 		 598 aa  338  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  34.03 
 
 		 611 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  33.57 
 
 		 566 aa  337  9e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 620 aa  337  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  40 
 
 		 641 aa  337  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.5 
 
 		 606 aa  336  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.47 
 
 		 589 aa  336  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.4 
 
 		 575 aa  336  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  38.77 
 
 		 634 aa  335  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  33.16 
 
 		 592 aa  335  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  35.26 
 
 		 604 aa  335  3e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 603 aa  335  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 586 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 		 591 aa  335  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  29.87 
 
 		 1194 aa  334  5e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  34.05 
 
 		 600 aa  334  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.25 
 
 		 611 aa  334  6e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 596 aa  334  8e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  31.92 
 
 		 590 aa  333  9e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  33.04 
 
 		 594 aa  333  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  38.26 
 
 		 623 aa  333  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 		 566 aa  333  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  38.72 
 
 		 588 aa  333  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  41.52 
 
 		 633 aa  332  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.69 
 
 		 602 aa  332  3e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  35.06 
 
 		 782 aa  331  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.68 
 
 		 594 aa  330  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  36.82 
 
 		 627 aa  330  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 764 aa  330  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.51 
 
 		 581 aa  330  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  33.85 
 
 		 609 aa  330  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  38.72 
 
 		 615 aa  330  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  33.98 
 
 		 613 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.62 
 
 		 597 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  31.87 
 
 		 587 aa  328  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  41.88 
 
 		 589 aa  328  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.35 
 
 		 602 aa  328  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.62 
 
 		 597 aa  328  5e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.78 
 
 		 764 aa  327  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 		 611 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.05 
 
 		 578 aa  326  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.37 
 
 		 764 aa  326  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.74 
 
 		 579 aa  325  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  37.76 
 
 		 641 aa  326  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  35.44 
 
 		 632 aa  326  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  37.35 
 
 		 650 aa  325  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>