More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0909 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  100 
 
 
563 aa  1084    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  48.98 
 
 
537 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  50.91 
 
 
563 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  44.15 
 
 
583 aa  382  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  44.37 
 
 
603 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  45.88 
 
 
536 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  45.66 
 
 
564 aa  334  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  44.61 
 
 
561 aa  331  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  44.26 
 
 
562 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  37.25 
 
 
547 aa  301  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
546 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.83 
 
 
585 aa  289  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4140  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
548 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  44.28 
 
 
550 aa  277  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  40.11 
 
 
566 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  37.59 
 
 
563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22700  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.61 
 
 
600 aa  269  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  43.36 
 
 
551 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2732  ABC transporter related  40.04 
 
 
552 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107306  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2616  ABC transporter related  39.47 
 
 
540 aa  246  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25030  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.41 
 
 
548 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  32.55 
 
 
653 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
545 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.16 
 
 
555 aa  230  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  36.9 
 
 
542 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1328  ABC transporter related protein  36.46 
 
 
553 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651131  hitchhiker  0.00125797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0889  ABC transporter related  34.04 
 
 
554 aa  223  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  29.98 
 
 
642 aa  221  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.89 
 
 
641 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5299  ABC transporter related  37.34 
 
 
553 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5678  ABC transporter related  37.34 
 
 
553 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5388  ABC transporter related  37.34 
 
 
553 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.378232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  35.5 
 
 
545 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  32.01 
 
 
631 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
631 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 
631 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.19 
 
 
644 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
631 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
631 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.41 
 
 
634 aa  216  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 
631 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.33 
 
 
550 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
631 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  29.27 
 
 
646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.39 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.047738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 
631 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 
631 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.28 
 
 
643 aa  213  9e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4909  ABC transporter related  37.06 
 
 
551 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00241613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0995  ABC transporter related  36.75 
 
 
550 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  32.47 
 
 
631 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  32.08 
 
 
631 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5841  ABC transporter-related protein  37.31 
 
 
548 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334221  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  29.76 
 
 
667 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 
560 aa  211  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.77 
 
 
659 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  30.82 
 
 
630 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.38 
 
 
555 aa  209  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  30.2 
 
 
642 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0923  ABC transporter related  37.82 
 
 
553 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  36.83 
 
 
537 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 
625 aa  206  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 
644 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  29 
 
 
645 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 
644 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  29.84 
 
 
642 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 
555 aa  205  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  30.58 
 
 
658 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  28.39 
 
 
518 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  28.39 
 
 
518 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 
659 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 
662 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 
658 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.73 
 
 
658 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.95 
 
 
620 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 
640 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  27.54 
 
 
643 aa  203  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 
658 aa  203  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 
658 aa  203  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  29.45 
 
 
640 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.36 
 
 
659 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  31.72 
 
 
554 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  29.64 
 
 
644 aa  201  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  28.06 
 
 
621 aa  201  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  27.22 
 
 
643 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  32.9 
 
 
625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  35.63 
 
 
624 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  29.35 
 
 
532 aa  200  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  27.36 
 
 
643 aa  200  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  31.63 
 
 
649 aa  200  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  28.65 
 
 
638 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  28.52 
 
 
643 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  31.01 
 
 
641 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  29.32 
 
 
879 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  37.48 
 
 
569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 
547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.94 
 
 
559 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  33.21 
 
 
625 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  28.65 
 
 
646 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>