More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0864 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0864  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 475 aa  932    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.493178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  59.03 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  56.21 
 
 		 473 aa  467  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  53.79 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0645  DNA repair protein RadA  58.78 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0366  DNA repair protein RadA  55.53 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  54.35 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  56.91 
 
 		 475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35070  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.773163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  55.31 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  55.38 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  58.1 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  57.86 
 
 		 481 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  56.19 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  54.77 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4699  DNA repair protein RadA  57.42 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  56.5 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  53.56 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  56.22 
 
 		 478 aa  438  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0150  DNA repair protein RadA  53.96 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627247  normal  0.549694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  51.97 
 
 		 467 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  54.46 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4258  DNA repair protein RadA  58.54 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0397  DNA repair protein RadA  54.41 
 
 		 498 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0599  DNA repair protein RadA  55.98 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.316853  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  56 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0359  DNA repair protein RadA  54.99 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  hitchhiker  0.00589399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4828  DNA repair protein RadA  51.66 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5128  DNA repair protein RadA  51.43 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.764257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4742  DNA repair protein RadA  51.66 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  45.85 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13618  DNA repair protein RadA  52.43 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  51.77 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 512 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  41.32 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.02 
 
 		 457 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  41.32 
 
 		 458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  41.32 
 
 		 458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  41.89 
 
 		 458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  41.32 
 
 		 458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  41.32 
 
 		 458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  41.32 
 
 		 458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  41.1 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  41.1 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  41.1 
 
 		 458 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  40.35 
 
 		 453 aa  359  5e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  45.43 
 
 		 450 aa  358  9e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  39.37 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  40.88 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  43.08 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  45.85 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  43.58 
 
 		 453 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  39.51 
 
 		 451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  43.08 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  40.81 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  44.27 
 
 		 445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  41.94 
 
 		 453 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  43.83 
 
 		 462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  43.75 
 
 		 453 aa  352  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  41.39 
 
 		 462 aa  352  8e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  42.55 
 
 		 464 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  42.63 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  42.41 
 
 		 451 aa  350  3e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  39.25 
 
 		 454 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  39.25 
 
 		 454 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  38.6 
 
 		 459 aa  349  8e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  43.02 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  42.41 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  38.6 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  39.82 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  36.92 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  42.73 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  43.39 
 
 		 458 aa  346  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  43.46 
 
 		 458 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  43.4 
 
 		 455 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  43.17 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  38.77 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  41.39 
 
 		 448 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  42.79 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 458 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 458 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  38.8 
 
 		 456 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  43.53 
 
 		 458 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 458 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 458 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 458 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  43.24 
 
 		 458 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  43.11 
 
 		 458 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  43.72 
 
 		 448 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  43.11 
 
 		 458 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  43.46 
 
 		 458 aa  342  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  43.75 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  43.58 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  42.89 
 
 		 476 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  41.41 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  37.94 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1461  DNA repair protein RadA  43.33 
 
 		 454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.421655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>