More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5346 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  86.06 
 
 		 291 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  79.79 
 
 		 288 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  79.79 
 
 		 288 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  79.79 
 
 		 288 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  76.6 
 
 		 304 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  65.19 
 
 		 300 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  65.74 
 
 		 329 aa  352  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  64.29 
 
 		 303 aa  352  5.9999999999999994e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  63.57 
 
 		 293 aa  345  7e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  64.18 
 
 		 300 aa  319  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  60.28 
 
 		 299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  58.3 
 
 		 296 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  59.57 
 
 		 299 aa  298  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  57.35 
 
 		 300 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  56.64 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  57.09 
 
 		 287 aa  291  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  58.3 
 
 		 303 aa  291  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  55.48 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  55.32 
 
 		 291 aa  289  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  55.48 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  58.3 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  58.01 
 
 		 307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  53 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  54.61 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  50.71 
 
 		 311 aa  251  7e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  54.87 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  52.94 
 
 		 311 aa  241  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  52.52 
 
 		 581 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  49.64 
 
 		 285 aa  237  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  50.17 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  51.84 
 
 		 315 aa  235  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  52.3 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  46.64 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  46.88 
 
 		 313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  45.15 
 
 		 347 aa  215  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.4 
 
 		 331 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  39.48 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  42.91 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  38.91 
 
 		 318 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  39.77 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.38 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  38.86 
 
 		 401 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.04 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  39.29 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  39.25 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  38.78 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  42.51 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  42.37 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  43.96 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  41.4 
 
 		 384 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  37.6 
 
 		 373 aa  142  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  40.32 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  38.57 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.46 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  38.78 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2605  A/G-specific adenine glycosylase MutY  40.94 
 
 		 415 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.443886  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  39.61 
 
 		 371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.8 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.27 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  42.61 
 
 		 615 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 365 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0131  A/G-specific adenine glycosylase  33.8 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0707  A/G-specific adenine glycosylase  41.46 
 
 		 367 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0262508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 355 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0652  A/G-specific adenine glycosylase  41.46 
 
 		 365 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.88939  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  34.91 
 
 		 365 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  34.91 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  34.91 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  40.82 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  41.41 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  39.7 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  40.31 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  42.11 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0543  A/G-specific adenine glycosylase  42.44 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158225  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  36.43 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.98 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  39.71 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  40.5 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  37.55 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  38.58 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>