More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2747 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  87.06 
 
 		 479 aa  780    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  100 
 
 		 478 aa  965    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  66.26 
 
 		 475 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  66.26 
 
 		 475 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  66.26 
 
 		 475 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  62.1 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  55.46 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  55.46 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  55.46 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  57.27 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  57.26 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  57.32 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  52.81 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  52.81 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  57.29 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  60 
 
 		 225 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  58.59 
 
 		 248 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  58.08 
 
 		 256 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  58.59 
 
 		 257 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  58.59 
 
 		 257 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  58.59 
 
 		 257 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  56.5 
 
 		 256 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  56.5 
 
 		 256 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  57.07 
 
 		 248 aa  233  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  56.06 
 
 		 256 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  56.06 
 
 		 256 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  57.58 
 
 		 256 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  53.23 
 
 		 239 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  53.77 
 
 		 230 aa  223  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  53.54 
 
 		 221 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  53.54 
 
 		 241 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  53.54 
 
 		 241 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  53 
 
 		 228 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  53.4 
 
 		 253 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  57.06 
 
 		 164 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  60.42 
 
 		 505 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  31.92 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  62.41 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  56.49 
 
 		 249 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  44.93 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  41.95 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  40.84 
 
 		 214 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  41.38 
 
 		 204 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 204 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2970  NLP/P60 protein  38.76 
 
 		 208 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.79 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 340 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.29 
 
 		 531 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  40.6 
 
 		 388 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 625 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  36.3 
 
 		 337 aa  97.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  38.03 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  38.74 
 
 		 417 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 308 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  40 
 
 		 350 aa  90.9  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  36.84 
 
 		 459 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  38.53 
 
 		 345 aa  89.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.25 
 
 		 321 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.15 
 
 		 1048 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  39.25 
 
 		 342 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.35 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 378 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  38.32 
 
 		 337 aa  86.7  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  42.61 
 
 		 302 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 180 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  37.68 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  45.16 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  38.6 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  39.05 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.55 
 
 		 329 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  34.38 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  34 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  34.76 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  34.27 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  37.31 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  32.84 
 
 		 234 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 190 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 348 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.83 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  34.96 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  34.09 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  33.58 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>