More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2835 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
276 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.76 
 
 
279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.136509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0309  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.25 
 
 
277 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0034  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  57.32 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.43 
 
 
285 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.31 
 
 
285 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.03471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.17 
 
 
285 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.39 
 
 
266 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  42.28 
 
 
277 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 
275 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 
275 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.39 
 
 
251 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.660602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 
251 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
275 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.39 
 
 
251 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1541  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  43.4 
 
 
281 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0456  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.33 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.43 
 
 
269 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0865715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
241 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.455347 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  41.28 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34520  ABC transporter permease  46.92 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132889  normal  0.0672965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2932  ABC transporter permease  46.92 
 
 
254 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.04 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  39.04 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  37.56 
 
 
287 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.74 
 
 
293 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0831  nitrate transport permease  31.89 
 
 
312 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
253 aa  122  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
253 aa  122  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3842  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.22 
 
 
331 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.85 
 
 
311 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.65 
 
 
279 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.86 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  32.62 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1391  NO3-/NO2- ABC transporter  31.37 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  34.77 
 
 
300 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
285 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  32.38 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.26 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.22 
 
 
283 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2588  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  33.67 
 
 
322 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2618  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  36.51 
 
 
279 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 
241 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.94 
 
 
266 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.31 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3741  nitrate transport permease  31.12 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  37.43 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2146  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.7 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  32.45 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0291  nitrate transport permease  29.89 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1147  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2832  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
313 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4662  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.22 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3973  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.08 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930991  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2321  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
313 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
279 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1413  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
311 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
253 aa  109  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3654  nitrate transport permease  31.18 
 
 
273 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1306  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
279 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  33.99 
 
 
241 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
291 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.11 
 
 
273 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2732  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.14 
 
 
304 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3523  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.08 
 
 
309 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  30.5 
 
 
264 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
264 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3268  nitrate transport permease  34.25 
 
 
328 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
231 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  normal  0.0160388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0666  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 
311 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0569164  decreased coverage  0.0039857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2555  nitrate transport permease  28 
 
 
314 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2496  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
304 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  32.98 
 
 
269 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
259 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.74 
 
 
304 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.68 
 
 
285 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3486  nitrate ABC transporter permease protein  34.92 
 
 
295 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
278 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  29.74 
 
 
260 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03653  putative nitrate ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 
349 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
288 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.89 
 
 
286 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2591  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.95 
 
 
328 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.96 
 
 
282 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1900  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.95 
 
 
252 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128113  hitchhiker  0.000000000000910228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5414  putative nitrate ABC transporter (permease protein) (ntrB-like protein)  33.69 
 
 
279 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  28.68 
 
 
285 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  31.79 
 
 
258 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1489  nitrate transport permease  33.5 
 
 
278 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
274 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2055  nitrate transport permease  32.62 
 
 
279 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>