More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1830 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 320 aa  630  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  65.02 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  61.59 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  65.29 
 
 		 314 aa  361  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  65.74 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  58.95 
 
 		 325 aa  353  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  64.73 
 
 		 372 aa  351  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  64.6 
 
 		 329 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  62.54 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  55.62 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  54.98 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  61.69 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  60.96 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  53.27 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  53.27 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  54.18 
 
 		 300 aa  319  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  62.98 
 
 		 313 aa  318  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  60.71 
 
 		 336 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  56.6 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  56.6 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  57.91 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  55.56 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  54.04 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  50.51 
 
 		 297 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  58.7 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  53.95 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  54.23 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  48.8 
 
 		 373 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  53.55 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  52.65 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  53.9 
 
 		 356 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  53.55 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  52.94 
 
 		 302 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  49.32 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  52.3 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  48.61 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  44.34 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  42.23 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  42.57 
 
 		 307 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  43.11 
 
 		 305 aa  215  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  39.07 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.98 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.88 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  35.9 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  35.36 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  38.31 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.09 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.69 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  35.1 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  36.19 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  34.49 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.59 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  39.23 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  35.52 
 
 		 299 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  36.46 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  35.17 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 316 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.17 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  34.92 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.15 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  36.77 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  36.82 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.83 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.83 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.48 
 
 		 299 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.83 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.47 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  38.06 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  38.93 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  38.97 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  35.81 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 		 295 aa  162  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  36.5 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  34.18 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  36.31 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>