More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0063 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  64.26 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  63.01 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  53.19 
 
 		 236 aa  251  7e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  54.2 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  52.52 
 
 		 238 aa  245  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.07 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  51.5 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  56.22 
 
 		 236 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  51.5 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  51.07 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.05 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.56 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50.64 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 234 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.28 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50.21 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 237 aa  241  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  51.07 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 238 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.63 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.94 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  50.43 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  51.68 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.28 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  54.7 
 
 		 256 aa  238  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  53.36 
 
 		 240 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  52.52 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  49.79 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  52.63 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  51.27 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  54.51 
 
 		 234 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  49.37 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  47.46 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  51.07 
 
 		 260 aa  234  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.21 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  53.62 
 
 		 234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  52.3 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  52.36 
 
 		 244 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  232  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  53.22 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  52.94 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  51.68 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  48.93 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  52.36 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  53.65 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  49.37 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  51.06 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  48.07 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  50.64 
 
 		 437 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  48.5 
 
 		 265 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  48.5 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  53.36 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  55.46 
 
 		 832 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  51.71 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  48.5 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  50 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.93 
 
 		 242 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  47.88 
 
 		 242 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  48.5 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.29 
 
 		 235 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.93 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  48.29 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  52.52 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  51.71 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  51.05 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  48.1 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  53.62 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  48.29 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.71 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  52.97 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  48.5 
 
 		 249 aa  226  4e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  51.68 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>