More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1279 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  292  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.32 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.32 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.32 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.32 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.32 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.32 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.32 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.32 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  30.91 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  30.28 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  28.03 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  27.27 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  27.27 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  29.79 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  38.55 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>