More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0426 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0426  Crp/Fnr family transcriptional regulator  100 
 
 
202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.86211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2484  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  74.75 
 
 
202 aa  311  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1015  CRP/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 
204 aa  208  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000202163  unclonable  0.0000000139192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0375  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.02 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.887845  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1419  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
208 aa  104  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1482  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.7 
 
 
196 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.053801  hitchhiker  0.0000318932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.86 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.42 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.14 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.26 
 
 
235 aa  72  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  29.15 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  30.51 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  29.1 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.57 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.57 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.12 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.99 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.15 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  28.36 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3690  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142322  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1360  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.08 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  26.59 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.08 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  27.51 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.14 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1896  cyclic nucleotide-binding protein  31.71 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6158  cyclic nucleotide-binding protein  29.21 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  28.11 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
231 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647195  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.63 
 
 
229 aa  63.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.76 
 
 
225 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  28.18 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.59 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  26.67 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  26.94 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
247 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  27.72 
 
 
254 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
240 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
225 aa  62.4  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1697  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.16 
 
 
259 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  hitchhiker  0.0000199045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1070  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
235 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105875  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  29.9 
 
 
231 aa  62  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  28.49 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.53 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  28.49 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
252 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.83 
 
 
228 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.56 
 
 
240 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.05 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
254 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  28.49 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  28.49 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.02 
 
 
243 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0120  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  26.9 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  28.49 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  26.74 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  27.96 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  26.67 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  26.67 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  27.96 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  26.67 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  26.67 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  26.67 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.98 
 
 
243 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  27.22 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>