More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5512 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0593  urea ABC transporter, urea binding protein  85.07 
 
 		 418 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3572  ABC transporter substrate-binding protein  85.55 
 
 		 422 aa  750    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0654  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  85.42 
 
 		 391 aa  696    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.379667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1443  urea ABC transporter, urea binding protein  82.31 
 
 		 420 aa  727    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1252  amide-urea binding protein  84.18 
 
 		 392 aa  693    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0854371  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6186  urea ABC transporter, urea binding protein  95.12 
 
 		 410 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411723  normal  0.830735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5512  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 422 aa  874    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115941  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1139  urea ABC transporter, urea binding protein  76.32 
 
 		 413 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1711  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  74 
 
 		 421 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3381  ABC transporter substrate-binding protein  84.36 
 
 		 417 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1360  urea ABC transporter, urea binding protein  75.57 
 
 		 413 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3864  amide-urea binding protein  83.82 
 
 		 420 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1200  urea ABC transporter, urea binding protein  75.57 
 
 		 413 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3690  urea ABC transporter, urea binding protein  84.36 
 
 		 417 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0976  urea ABC transporter, urea binding protein  83.33 
 
 		 426 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  72.22 
 
 		 421 aa  616  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4078  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  72.44 
 
 		 414 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.749846  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3732  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  71.29 
 
 		 424 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4636  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  71.29 
 
 		 424 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3587  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.04 
 
 		 418 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5668  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  71.29 
 
 		 424 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0220  urea ABC transporter, urea binding protein  71.92 
 
 		 421 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3145  urea ABC transporter, urea binding protein  72.75 
 
 		 422 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1775  twin-arginine translocation pathway signal  72.93 
 
 		 414 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0564  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  71.25 
 
 		 420 aa  594  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2975  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  73.4 
 
 		 416 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3112  urea ABC transporter, urea binding protein  67.16 
 
 		 416 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1597  urea ABC transporter, urea binding protein  71.61 
 
 		 414 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.948764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  59.94 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2418  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.3 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  54.3 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  51.65 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  53.02 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  48.06 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  47.09 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  45.74 
 
 		 423 aa  353  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  46.8 
 
 		 440 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  45.5 
 
 		 419 aa  349  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  47.47 
 
 		 405 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  46.35 
 
 		 421 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1674  urea ABC transporter, urea binding protein  45.11 
 
 		 407 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  45.91 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  45.31 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  45.31 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  44.47 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  44.54 
 
 		 463 aa  321  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2620  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  47.68 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0558299  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  46.52 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29741  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  47.51 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08881  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  45.36 
 
 		 425 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2250  putative urea ABC transporter, urea binding protein  44.77 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.582147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  43.27 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3881  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  42.62 
 
 		 411 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2193  urea ABC transporter, urea binding protein  40.94 
 
 		 418 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1870  urea ABC transporter, urea binding protein  40.94 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1443  twin-arginine translocation pathway signal  41.77 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0952  twin-arginine translocation pathway signal  38.9 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553309  normal  0.40345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2041  putative urea/short-chain amide-binding signal peptide protein  41.67 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3931  urea ABC transporter, urea binding protein  42.89 
 
 		 417 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.606906  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0994  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  42.02 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.603537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5579  hypothetical protein  42.25 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64270  hypothetical protein  42.25 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00916173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3381  twin-arginine translocation pathway signal  41.2 
 
 		 419 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2482  urea ABC transporter, urea binding protein  41.2 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0880  urea ABC transporter, urea binding protein  40.96 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0431  twin-arginine translocation pathway signal  40.96 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0910  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  40.96 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988343  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0829  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  45.11 
 
 		 425 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1662  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  40.71 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0986  twin-arginine translocation pathway signal  40.62 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4014  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.72 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0416471  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08861  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  45.11 
 
 		 425 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1048  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  44.61 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.293483  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19191  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  44.61 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3683  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.71 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1084  urea ABC transporter, urea binding protein  41.54 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0787  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.72 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0798  urea ABC transporter, urea binding protein  40.72 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.398503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2500  urea ABC transporter, urea binding protein  41.44 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3780  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  40.27 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.583472  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0954  urea ABC transporter, urea binding protein  39.23 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4012  urea ABC transporter, urea binding protein  40.62 
 
 		 422 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1393  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656328  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1988  putative substrate-binding periplasmic transport protein  40 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.146215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0701  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  41.71 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2161  urea ABC transporter, urea binding protein  41.18 
 
 		 422 aa  288  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2251  urea ABC transporter, urea binding protein  39.23 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0697  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.47 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3211  twin-arginine translocation pathway signal  41.87 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.35137  normal  0.840301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1255  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic protein  41.05 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0997  twin-arginine translocation pathway signal  40.38 
 
 		 427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4426  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.71 
 
 		 421 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3500  twin-arginine translocation pathway signal  41.87 
 
 		 420 aa  285  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4841  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  40 
 
 		 421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.365474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1504  urea/short-chain amide ABC transporter, periplasmic urea/short-chain amide-binding protein  40.91 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00196796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4719  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40 
 
 		 421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  0.0383938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2746  urea ABC transporter, urea binding protein  41.6 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  42.5 
 
 		 840 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4898  urea ABC transporter, urea binding protein  41.71 
 
 		 421 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0590  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.18 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>