More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5226 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  87.97 
 
 
389 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
388 aa  758    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
404 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
407 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4152  histidine kinase  31.32 
 
 
662 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
673 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
446 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
406 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  32.36 
 
 
446 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
443 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01273  putative two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid  31.01 
 
 
702 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  30.61 
 
 
1414 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  36.51 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0264  Signal transduction histidine kinase-like  31.11 
 
 
666 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.21 
 
 
1797 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  35.17 
 
 
594 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  32.56 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
1131 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  31.3 
 
 
454 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  35.34 
 
 
667 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
378 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  29.09 
 
 
448 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
386 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 
587 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
424 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
379 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
720 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  31.49 
 
 
628 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
379 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  33.2 
 
 
1298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3300  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1058 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
770 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
1406 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  32.17 
 
 
617 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  32.02 
 
 
461 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
1711 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
1691 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
1383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6422  histidine kinase  33.61 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  32.02 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  29.37 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  32 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
1361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
640 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
372 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
395 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  30.13 
 
 
614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  33.33 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  32.54 
 
 
588 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
556 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  29.88 
 
 
1526 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
1385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
797 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  29.2 
 
 
790 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
592 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  28.01 
 
 
598 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
639 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  26.98 
 
 
773 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  33.33 
 
 
508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
584 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
1172 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  30.61 
 
 
401 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
639 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  30.71 
 
 
779 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
1048 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
764 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
546 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
387 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
383 aa  109  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
782 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
1160 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
769 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
1010 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
1559 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
374 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  29.17 
 
 
560 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
1645 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
519 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
784 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
769 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
531 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  24.42 
 
 
544 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
656 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  25.19 
 
 
677 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  29.84 
 
 
771 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
697 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
768 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
861 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
584 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>