70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1395 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  100 
 
 
1291 aa  2459    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  38.31 
 
 
1329 aa  770    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  45.97 
 
 
1297 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  39.94 
 
 
1264 aa  389  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  39 
 
 
1422 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  35.2 
 
 
1264 aa  383  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  34.95 
 
 
1264 aa  380  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  34.83 
 
 
1264 aa  376  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  40.17 
 
 
1262 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  39.08 
 
 
1127 aa  360  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  40.16 
 
 
1216 aa  352  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  36.05 
 
 
1104 aa  346  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  36.67 
 
 
963 aa  337  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  38.7 
 
 
1130 aa  336  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  40 
 
 
1083 aa  334  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  39.51 
 
 
1099 aa  312  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  32.15 
 
 
1210 aa  298  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  32.15 
 
 
1210 aa  298  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  37.62 
 
 
1086 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  41.75 
 
 
1012 aa  285  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  36.78 
 
 
1086 aa  283  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  37.5 
 
 
1314 aa  280  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  31.38 
 
 
1210 aa  280  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  31.85 
 
 
1209 aa  280  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  31.07 
 
 
1210 aa  280  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  31.38 
 
 
1210 aa  278  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  40.18 
 
 
1055 aa  277  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  31.38 
 
 
1220 aa  274  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  38.58 
 
 
1001 aa  270  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  38.47 
 
 
1116 aa  258  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  34.42 
 
 
1125 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  39.18 
 
 
1178 aa  245  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  37.47 
 
 
988 aa  223  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  29.29 
 
 
1139 aa  168  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  29.35 
 
 
1139 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  30.52 
 
 
1137 aa  165  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  28.86 
 
 
1139 aa  164  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  28.29 
 
 
1139 aa  163  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  24.09 
 
 
1108 aa  129  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  32.19 
 
 
971 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  26.15 
 
 
1146 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.06 
 
 
1275 aa  111  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  29.34 
 
 
1249 aa  105  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  24.22 
 
 
465 aa  90.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  18.89 
 
 
903 aa  86.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  21.89 
 
 
1094 aa  85.9  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  22.1 
 
 
857 aa  85.5  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  21.03 
 
 
898 aa  80.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.73 
 
 
800 aa  70.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  20.85 
 
 
754 aa  67.8  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  21.92 
 
 
762 aa  67.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  45.31 
 
 
1088 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  44.12 
 
 
1822 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  24.73 
 
 
837 aa  62.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  22.52 
 
 
634 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  19.22 
 
 
789 aa  60.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  43.86 
 
 
1822 aa  60.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  41.94 
 
 
1440 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  46.88 
 
 
1838 aa  56.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  23.12 
 
 
739 aa  53.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.65 
 
 
852 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  41.79 
 
 
252 aa  49.7  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  38.75 
 
 
146 aa  49.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  35.59 
 
 
475 aa  48.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4135  WGR domain protein  40 
 
 
475 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 
1030 aa  47.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  42.86 
 
 
182 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  37.35 
 
 
184 aa  45.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  36.51 
 
 
263 aa  45.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  36.51 
 
 
263 aa  45.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>