More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0774 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
315 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0360339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.14 
 
 
346 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.14 
 
 
346 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.388725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.08 
 
 
302 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0679369  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.08 
 
 
302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.26 
 
 
307 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  34.62 
 
 
307 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  34.62 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3072  UDP-glucose 4-epimerase  34.52 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 
303 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 
302 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179855  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.69 
 
 
311 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0242314  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
292 aa  162  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000135991  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0633  epimerase protein  34.52 
 
 
290 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
298 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0418863  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0596  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
280 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1128  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase/reductase  31.44 
 
 
287 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
283 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1426  hypothetical protein  30.92 
 
 
282 aa  109  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0301389  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 
284 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
305 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
311 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
281 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  31.11 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
370 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
310 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
313 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  25.21 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  25.15 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  27.3 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.27 
 
 
305 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.61 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10430  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.39 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
370 aa  87  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
370 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  25.59 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  26.39 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  31.07 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
345 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  28.7 
 
 
329 aa  85.9  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  28.79 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  28.25 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  26.71 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
669 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  25.07 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  26.72 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  28.93 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033551  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  21.1 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  24.21 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  23.4 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  25.73 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  27.86 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  29.39 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.312436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  26.1 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  25.15 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  27.86 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  25.36 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  27.06 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  23.32 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.09 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  30.68 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3742  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  28.24 
 
 
327 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
328 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0776  UDP-glucose 4-epimerase  25.16 
 
 
281 aa  79  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10863  normal  0.0916444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>