178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0287 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
315 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  84.76 
 
 
313 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  84.44 
 
 
313 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0285  putative sugar transferase  46.74 
 
 
294 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0463119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0144  putative sugar transferase  46.35 
 
 
284 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0201  putative sugar transferase  47.08 
 
 
296 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.537288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1389  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
283 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1228  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
290 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.824423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3662  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
283 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1165  glycosyl transferase family 2  41.32 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0721  glycosyltransferase-like protein  36.74 
 
 
275 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3876  putative sugar transferase  39.48 
 
 
283 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4443  putative sugar transferase  37.68 
 
 
301 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.296874  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  38.79 
 
 
300 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3363  glycosyl transferase family 2  40.07 
 
 
288 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00021305  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  34.15 
 
 
664 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01232  glycosyl transferase, family 2  27.74 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.88 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
891 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  26.96 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
684 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
328 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  30.59 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
262 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
924 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
419 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
455 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
259 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  26.57 
 
 
515 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
273 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  32 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  24.31 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
501 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3392  glycosyl transferase, family 2  26.36 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000856485 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  24.26 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
477 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
322 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
321 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
597 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
310 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0217  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
307 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
348 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
672 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  31.3 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  22.63 
 
 
515 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  21.03 
 
 
516 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5002  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
786 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000902541 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0047  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3592  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
405 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
528 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
352 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  32 
 
 
461 aa  50.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
308 aa  49.3  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  29.14 
 
 
312 aa  49.3  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
413 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  33.02 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
836 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  31.08 
 
 
474 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>