211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0295 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  68.28 
 
 		 187 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  51.1 
 
 		 189 aa  205  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  56.28 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  50.82 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  54.1 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  51.37 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  51.1 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  51.1 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  50 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  50.82 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  50.82 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  48.9 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  49.45 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  48.09 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  46.41 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  46.41 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  45.05 
 
 		 220 aa  157  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  44.32 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  45.86 
 
 		 204 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  46.24 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  44.75 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  44.56 
 
 		 196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  42.47 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  42.39 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  43.02 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  39.89 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  43.02 
 
 		 184 aa  130  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  36.16 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  46.08 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  44.12 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2032  HNH endonuclease  45.05 
 
 		 205 aa  92  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.623181  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  51.95 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  50 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1340  HNH endonuclease  47 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0414057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  55.22 
 
 		 168 aa  88.2  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  51.95 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 198 aa  87.8  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.69 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 169 aa  87.8  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  54.05 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  45.36 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  37.5 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  36.05 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  43 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  41.94 
 
 		 168 aa  84.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  48.35 
 
 		 197 aa  84.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  41.94 
 
 		 168 aa  84.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2542  HNH endonuclease  46.88 
 
 		 169 aa  84.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  32.9 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  54.22 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  42.27 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  51.32 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  44.21 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  48.75 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  37.17 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  41.94 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  50 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  43.01 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  47.62 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  43.01 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  45.26 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  38.26 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  40.86 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  41.94 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  45.92 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  38.46 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  42.7 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  42.27 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  41.05 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  39.64 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  46.25 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  31.76 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  46.25 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  47.95 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  39.25 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  40.86 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>