87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1244 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  57.1 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  55.79 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  59.44 
 
 		 339 aa  315  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  55.69 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  55.69 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  54.19 
 
 		 337 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  53.01 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  56.13 
 
 		 372 aa  301  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  54.83 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  46.47 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  42.35 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  38.78 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  37.07 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  37.99 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  40.4 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  35.45 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  41.03 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  38.33 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  31.86 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  40.06 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  40.06 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  37.38 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  36.94 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  43.35 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  38.56 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  34.35 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  35.94 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  37.15 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  36.72 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  31.92 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  31.92 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  35.96 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  34.53 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  25.53 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  35.5 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  27.36 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  32.76 
 
 		 323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  26.83 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  34.92 
 
 		 943 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  28.03 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  27.11 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  27.27 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  27.1 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  27.19 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  28.72 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  24.19 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  28.66 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  26.42 
 
 		 353 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  29.36 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  27.02 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  24.61 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  25.53 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  24.41 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  27.3 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  30.11 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  22.02 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  26.83 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  26.54 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  26.14 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  26.14 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  25.82 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  25.82 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  25.93 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  25.52 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  21.19 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.39 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  27.46 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  27.3 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  29.75 
 
 		 263 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  30.06 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  25.3 
 
 		 384 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  25.61 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  25.33 
 
 		 384 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.21 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  24.54 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  19.83 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  29.08 
 
 		 466 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  27.31 
 
 		 386 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0630  hypothetical protein  22.84 
 
 		 462 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28147  normal  0.395261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  30.77 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  29.58 
 
 		 467 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  20.19 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  26.32 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  26.79 
 
 		 402 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>