60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0066 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  100 
 
 		 267 aa  530  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  60.77 
 
 		 258 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  50 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5186  beta-lactamase domain protein  47.31 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3939  beta-lactamase-like  47.18 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0922  beta-lactamase domain protein  43.24 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  43.85 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  44.87 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2128  beta-lactamase-like protein  43.27 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  43.44 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0960  cyclic-AMP phosphodiesterase  39.84 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.160022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0298  cyclic-AMP phosphodiesterase  42.46 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2634  beta-lactamase domain protein  43.5 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1579  beta-lactamase domain protein  42.97 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  36.12 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4089  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.923622  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 796 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0338  cyclic-AMP phosphodiesterase  29.41 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0402  hypothetical protein  27.27 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.424061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0426  metallo-beta-lactamase family protein  27.67 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1916  hypothetical protein  27.3 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1224  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.96 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1926  hypothetical protein  26.6 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1164  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.09 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_367  metallo-beta-lactamase  26.09 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.523669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1253  cyclic-AMP phosphodiesterase  28.25 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0807083  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1113  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.73 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000266448  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3587  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  26.42 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4352  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.52 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0524869  normal  0.0439524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1607  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  25.86 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3675  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  26.02 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00829  cAMP-specific phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14890)  31.18 
 
 		 561 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.14 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0381  cyclic-AMP phosphodiesterase  26.15 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.1 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1625  3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase  24.39 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0207595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  27.08 
 
 		 550 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 652 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  26.67 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 546 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  27.57 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 595 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1144  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1429  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 546 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  33.91 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  25.51 
 
 		 468 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  21.76 
 
 		 455 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0199  phosphonate metabolism  32.32 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  29.09 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>