More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2784 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  100 
 
 		 400 aa  788    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  73.62 
 
 		 398 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  73.05 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  70.07 
 
 		 402 aa  544  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  69.02 
 
 		 397 aa  534  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  68.17 
 
 		 402 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  67.09 
 
 		 399 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  61.31 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0771  ammonium transporter  60.93 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00637331  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  57.04 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  56.36 
 
 		 408 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  56.11 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  53.03 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  53.65 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  55.86 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  51.77 
 
 		 488 aa  401  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  53.71 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  53.35 
 
 		 451 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  52.36 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  53.5 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  51.42 
 
 		 489 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  51.61 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  50.59 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  50.62 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  50.99 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  49.17 
 
 		 515 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  48.94 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  49.3 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  51.99 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  48.71 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  48.02 
 
 		 410 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  52.14 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  48.51 
 
 		 410 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  48.27 
 
 		 410 aa  364  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  48.02 
 
 		 410 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  48.99 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  51.41 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  48.02 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  48.02 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  49.5 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  48.02 
 
 		 410 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  47.52 
 
 		 411 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  47.03 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.52 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  50.12 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  47.26 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  48.26 
 
 		 431 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  45.23 
 
 		 521 aa  352  7e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  53.63 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  47.86 
 
 		 402 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  49.5 
 
 		 411 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  48.3 
 
 		 499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  47.03 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  48.39 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  47.52 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  45.87 
 
 		 504 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.25 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  46.12 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  46.12 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  46.12 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  46.12 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  46.12 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  46.12 
 
 		 444 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  46.12 
 
 		 478 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  45.63 
 
 		 500 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.65 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.65 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  45.63 
 
 		 501 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  47.57 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  46.02 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  45.15 
 
 		 500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  45.15 
 
 		 500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  45.15 
 
 		 500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  47.24 
 
 		 401 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  48.74 
 
 		 401 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  44.29 
 
 		 463 aa  332  9e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  46.9 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  46.04 
 
 		 472 aa  328  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  48.14 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  48.01 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  46.12 
 
 		 503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  46.12 
 
 		 497 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  45.37 
 
 		 474 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  46.77 
 
 		 433 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  45.97 
 
 		 461 aa  322  6e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  46.53 
 
 		 437 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  45.2 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  46.5 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  45.11 
 
 		 429 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  45.05 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  46.25 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  44.2 
 
 		 432 aa  319  5e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  45.64 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  43.81 
 
 		 459 aa  319  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  46 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  47.32 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  44.53 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  44.17 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  44.17 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  43.92 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>