More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2634 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  100 
 
 		 184 aa  362  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  80.33 
 
 		 181 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  84.18 
 
 		 160 aa  268  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  74.58 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  60 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  61.35 
 
 		 201 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  62.11 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  59.38 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  66.89 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  53.95 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  52.94 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  49.02 
 
 		 169 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  54 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  49.32 
 
 		 174 aa  144  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  35.76 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  43.14 
 
 		 159 aa  94.4  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  35.06 
 
 		 404 aa  89.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  35.33 
 
 		 907 aa  88.6  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  37.14 
 
 		 333 aa  88.6  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.97 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  38.36 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  36.99 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  39.02 
 
 		 779 aa  82.4  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  36.59 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  34.33 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  36.99 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  34.25 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  32.34 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  34.04 
 
 		 425 aa  78.2  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.68 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  37.4 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  34.01 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  30.82 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.3 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.57 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.3 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.57 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  38.74 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  32.54 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  31.85 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  30.52 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  33.09 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  31.29 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  36.54 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  30.52 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  36.54 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  33.09 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  36.54 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  31.08 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  36.54 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  32.65 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  36.79 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.14 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  37.4 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  32.33 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  36.79 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  37.4 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  32.28 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  37.5 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  36.79 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  34.55 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  43.24 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.97 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.19 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  29.33 
 
 		 301 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.19 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.19 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.19 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  32.89 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.97 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.97 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.97 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  36.19 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.97 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  35.64 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.19 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.43 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.43 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  35.04 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.29 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.36 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  35.04 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  31.16 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  30.97 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  36.84 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  29.45 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.19 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  28.08 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  35.71 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  30.52 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  27.78 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  33.77 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  34.72 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  35.04 
 
 		 518 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.62 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  36.45 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.62 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>