More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0462 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  80.68 
 
 		 205 aa  350  8.999999999999999e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  79.23 
 
 		 205 aa  342  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  79.71 
 
 		 205 aa  339  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  72.46 
 
 		 205 aa  322  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  66.34 
 
 		 211 aa  288  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  63.18 
 
 		 203 aa  276  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  63.37 
 
 		 208 aa  275  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  63.21 
 
 		 210 aa  262  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  62.18 
 
 		 210 aa  256  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  56.7 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  59.09 
 
 		 215 aa  244  9e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  57.95 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  57.95 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  58.33 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  56.92 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  60.1 
 
 		 218 aa  239  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  59.59 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  57.51 
 
 		 202 aa  229  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  55.44 
 
 		 197 aa  228  7e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  54.92 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  56.48 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  56.84 
 
 		 202 aa  226  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  57.51 
 
 		 225 aa  224  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  55.38 
 
 		 205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  51.83 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  50.79 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  47.62 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  44.5 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  47.37 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  46.32 
 
 		 273 aa  158  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  46.11 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  45.88 
 
 		 252 aa  155  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  41.61 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  40.67 
 
 		 165 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  38.96 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  39.1 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  39.19 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  39.74 
 
 		 166 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  37.91 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  41.26 
 
 		 147 aa  99  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  38.96 
 
 		 166 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 147 aa  98.2  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  39.49 
 
 		 167 aa  98.2  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  39.76 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  38.46 
 
 		 173 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  37.66 
 
 		 168 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 164 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  35.37 
 
 		 172 aa  96.3  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  38 
 
 		 172 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  38.93 
 
 		 167 aa  96.3  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  35.06 
 
 		 165 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  35.06 
 
 		 165 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  38.82 
 
 		 166 aa  95.9  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  39.72 
 
 		 158 aa  95.5  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  37.84 
 
 		 172 aa  95.1  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  36.67 
 
 		 172 aa  95.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 182 aa  95.1  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2184  30S ribosomal protein S5  37.66 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  37.66 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2462  30S ribosomal protein S5  37.66 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  39.35 
 
 		 169 aa  94.7  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  37.84 
 
 		 162 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2201  30S ribosomal protein S5  37.66 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  39.16 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  38.1 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  39.16 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  35.5 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  36.54 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0336  30S ribosomal protein S5  37.91 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  41.1 
 
 		 146 aa  93.2  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  39.86 
 
 		 146 aa  93.6  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  36.49 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  37.01 
 
 		 168 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  35.62 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  36.88 
 
 		 147 aa  92.8  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  36.88 
 
 		 147 aa  92.8  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  37.97 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  36.88 
 
 		 147 aa  92.8  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  34.46 
 
 		 162 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  35.81 
 
 		 171 aa  92.4  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  39.73 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  34.62 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  37.16 
 
 		 177 aa  92  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  35.81 
 
 		 172 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1925  30S ribosomal protein S5  36.36 
 
 		 191 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  38.89 
 
 		 147 aa  92  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>