More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5469 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  91.51 
 
 		 600 aa  1039    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  76.34 
 
 		 602 aa  895    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  76.6 
 
 		 625 aa  883    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  76.6 
 
 		 625 aa  882    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  60.82 
 
 		 599 aa  728    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  78.15 
 
 		 630 aa  920    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  60.35 
 
 		 614 aa  708    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 595 aa  1207    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  53.48 
 
 		 582 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  56.43 
 
 		 585 aa  631  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  55.94 
 
 		 579 aa  628  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  54.04 
 
 		 582 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.14 
 
 		 584 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  53.58 
 
 		 614 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  53.11 
 
 		 584 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  52.4 
 
 		 584 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  51.38 
 
 		 607 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  51.01 
 
 		 594 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  51.38 
 
 		 607 aa  545  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  51.85 
 
 		 582 aa  545  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.28 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  49.35 
 
 		 572 aa  527  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.7 
 
 		 586 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.52 
 
 		 586 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  48.69 
 
 		 577 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  49.07 
 
 		 583 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  46.92 
 
 		 587 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  46.82 
 
 		 585 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  39.52 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  40.69 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  38.06 
 
 		 593 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.51 
 
 		 682 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  38.4 
 
 		 579 aa  332  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  37.12 
 
 		 593 aa  332  9e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  35.25 
 
 		 515 aa  328  2.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  36.09 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.28 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  37.28 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  36.87 
 
 		 597 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  35.86 
 
 		 584 aa  316  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 		 601 aa  314  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  35.83 
 
 		 581 aa  294  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 		 696 aa  294  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  35.62 
 
 		 646 aa  281  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 		 562 aa  280  5e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.71 
 
 		 656 aa  249  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 		 654 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 		 561 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 		 662 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.56 
 
 		 657 aa  236  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33 
 
 		 583 aa  234  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 		 577 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  32.73 
 
 		 577 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.94 
 
 		 660 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.56 
 
 		 657 aa  229  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 594 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 		 654 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.27 
 
 		 622 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 		 614 aa  229  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 		 582 aa  227  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  30.16 
 
 		 580 aa  226  9e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.89 
 
 		 570 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  29.8 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  31.63 
 
 		 596 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 		 657 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 578 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 613 aa  221  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 613 aa  221  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 		 586 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.02 
 
 		 703 aa  219  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.89 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 		 657 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  30.28 
 
 		 553 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 588 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  29.11 
 
 		 614 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  30.26 
 
 		 578 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 595 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  31.22 
 
 		 575 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  30.09 
 
 		 553 aa  214  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 		 582 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 		 595 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  31.84 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 		 587 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.5 
 
 		 710 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 		 624 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  29.36 
 
 		 631 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  31.32 
 
 		 740 aa  212  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>