56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2603 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  100 
 
 		 1032 aa  2032    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  95.06 
 
 		 1032 aa  1828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  36.83 
 
 		 1096 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  53.93 
 
 		 457 aa  326  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1203 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1353 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  30.65 
 
 		 1190 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1248 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1263 aa  280  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1192 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  32.03 
 
 		 1115 aa  171  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1164 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1127 aa  138  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  31.14 
 
 		 1160 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1268 aa  98.2  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  41.88 
 
 		 794 aa  94  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 783 aa  88.6  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 		 1285 aa  87.8  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  45.37 
 
 		 871 aa  87.8  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  40.28 
 
 		 674 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  43.55 
 
 		 915 aa  83.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  33.46 
 
 		 701 aa  79.7  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  97.56 
 
 		 735 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  35.88 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6570  hypothetical protein  41.94 
 
 		 341 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  30.31 
 
 		 669 aa  74.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  39.62 
 
 		 255 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  26.13 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  29.6 
 
 		 1122 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  39.32 
 
 		 921 aa  67.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  30.12 
 
 		 1835 aa  66.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  55.93 
 
 		 139 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  56 
 
 		 647 aa  65.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5968  hypothetical protein  85.71 
 
 		 422 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0115219  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  31.01 
 
 		 1906 aa  60.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  28.24 
 
 		 274 aa  57  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  31.03 
 
 		 908 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  24.54 
 
 		 970 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  34.74 
 
 		 718 aa  52.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  21.53 
 
 		 859 aa  51.6  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  21.53 
 
 		 859 aa  51.6  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  32.98 
 
 		 671 aa  51.6  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  22.1 
 
 		 857 aa  50.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  26.79 
 
 		 957 aa  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  21 
 
 		 913 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  25 
 
 		 853 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  31.65 
 
 		 735 aa  49.7  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  31.65 
 
 		 735 aa  49.7  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  25 
 
 		 853 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  25 
 
 		 853 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  26.1 
 
 		 849 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  23.6 
 
 		 1167 aa  48.9  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  41.03 
 
 		 1120 aa  47.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  27.73 
 
 		 968 aa  46.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  28.39 
 
 		 870 aa  45.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  36.89 
 
 		 192 aa  44.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>