More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2278 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
208 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  83.09 
 
 
213 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  72.95 
 
 
216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.01 
 
 
216 aa  296  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.15 
 
 
214 aa  287  8e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  69.23 
 
 
239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.08 
 
 
219 aa  276  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.67 
 
 
218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.83 
 
 
219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  65.7 
 
 
218 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.77 
 
 
219 aa  250  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.1 
 
 
216 aa  249  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.91 
 
 
219 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  59.62 
 
 
216 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.62 
 
 
216 aa  248  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.62 
 
 
216 aa  248  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.62 
 
 
216 aa  248  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  59.62 
 
 
216 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.62 
 
 
216 aa  248  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.32 
 
 
222 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  57.56 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.17 
 
 
215 aa  241  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.65 
 
 
215 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  56.73 
 
 
448 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.64 
 
 
229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3274  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.39 
 
 
218 aa  232  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.15 
 
 
226 aa  231  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  57.14 
 
 
216 aa  231  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.21 
 
 
213 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57.64 
 
 
209 aa  228  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  58.82 
 
 
213 aa  227  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.14 
 
 
215 aa  227  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.65 
 
 
218 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.65 
 
 
218 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.67 
 
 
221 aa  226  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  55.17 
 
 
221 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.65 
 
 
218 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.65 
 
 
218 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.65 
 
 
213 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  56.65 
 
 
213 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.74 
 
 
216 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.65 
 
 
213 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.65 
 
 
213 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.25 
 
 
216 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  56.65 
 
 
213 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.65 
 
 
213 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.65 
 
 
213 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  55.17 
 
 
218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.95 
 
 
219 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
218 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.65 
 
 
218 aa  224  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
218 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
218 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
218 aa  224  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.65 
 
 
218 aa  224  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.65 
 
 
218 aa  224  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.65 
 
 
218 aa  224  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  56.16 
 
 
218 aa  224  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
218 aa  224  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.25 
 
 
216 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.29 
 
 
241 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
213 aa  223  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.68 
 
 
219 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.68 
 
 
220 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.68 
 
 
220 aa  223  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  55.67 
 
 
218 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  56.16 
 
 
218 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.16 
 
 
211 aa  222  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.24 
 
 
219 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  55.67 
 
 
218 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.68 
 
 
218 aa  222  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.17 
 
 
218 aa  222  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57.77 
 
 
216 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.16 
 
 
213 aa  222  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.67 
 
 
218 aa  222  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6829  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.33 
 
 
209 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0752786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.68 
 
 
218 aa  222  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.76 
 
 
219 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.72 
 
 
213 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.1 
 
 
220 aa  221  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  55.67 
 
 
218 aa  221  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.33 
 
 
209 aa  222  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
213 aa  221  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.68 
 
 
218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.63 
 
 
202 aa  221  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.88 
 
 
219 aa  221  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
213 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.19 
 
 
218 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.65 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  54.68 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.47 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.17 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.16 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.17 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.19 
 
 
219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.17 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.96 
 
 
217 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  55.67 
 
 
218 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.12 
 
 
214 aa  218  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>