More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0875 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
315 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  52.73 
 
 
372 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  52.48 
 
 
332 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  52.26 
 
 
383 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  52.26 
 
 
384 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  51.19 
 
 
378 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  48.84 
 
 
308 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  51.43 
 
 
320 aa  275  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  50.67 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  51.01 
 
 
337 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  51.34 
 
 
337 aa  267  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  41.14 
 
 
316 aa  249  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  40.95 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 
313 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  39.68 
 
 
314 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001404  membrane-fusion protein  40.84 
 
 
315 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  38.38 
 
 
316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  39.86 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  38.68 
 
 
323 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  41.31 
 
 
317 aa  205  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1354  secretion protein HlyD family protein  40.98 
 
 
316 aa  178  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149353  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.02 
 
 
335 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  32.52 
 
 
333 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  32.49 
 
 
333 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  28.28 
 
 
329 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.52 
 
 
329 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.41 
 
 
335 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 
349 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.08 
 
 
331 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  26.17 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.36 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.15 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.15 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  24.91 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  29.06 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  26.04 
 
 
356 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.67 
 
 
335 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  27.27 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  26.38 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  27.43 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  27.43 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  27.72 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  27.43 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  27.43 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 
314 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  26.13 
 
 
327 aa  89.4  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  27.68 
 
 
323 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  28.25 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.93 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  26.42 
 
 
427 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  27.23 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  28.37 
 
 
377 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  27.89 
 
 
359 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  29.41 
 
 
347 aa  85.9  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  26.79 
 
 
326 aa  85.9  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  27.92 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  27.95 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25.74 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  25.42 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  23.47 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.87 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  24.62 
 
 
395 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  28.9 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  29.33 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  29.33 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  23.73 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  27.48 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  23.61 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  25.62 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  30.74 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  28.2 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  30.32 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  26.99 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  24.84 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 
467 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.61 
 
 
345 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 
500 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  27.02 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  27.22 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  29.28 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  25.24 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  29.05 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  27.3 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  28.1 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  29.28 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>