More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0480 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 656 aa  1341    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  24.01 
 
 		 696 aa  156  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 686 aa  126  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 602 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  22.71 
 
 		 668 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  22.8 
 
 		 677 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.75 
 
 		 680 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1098  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.9 
 
 		 633 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0013981  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  21.04 
 
 		 795 aa  101  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2670  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 607 aa  100  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  22.44 
 
 		 689 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 		 682 aa  98.2  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  20.41 
 
 		 802 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  20.69 
 
 		 782 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  27.18 
 
 		 588 aa  87.8  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  27.39 
 
 		 278 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  23.86 
 
 		 612 aa  84.7  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  23.52 
 
 		 660 aa  84.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.54 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4322  histidine kinase  25.45 
 
 		 636 aa  81.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.461598  normal  0.0714354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  30.33 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1256  histidine kinase  19.97 
 
 		 652 aa  81.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  29.2 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  27.96 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  25.11 
 
 		 535 aa  80.9  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  25.51 
 
 		 535 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 958 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.72 
 
 		 749 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 920 aa  79  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  27.35 
 
 		 549 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0448  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3414  diverse 7TM receptor, extracellular region 2  25.49 
 
 		 560 aa  77.4  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  22.9 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 535 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  26.24 
 
 		 698 aa  76.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 535 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 534 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.94 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  21.8 
 
 		 708 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  25.97 
 
 		 1111 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  27.69 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 679 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  25.75 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  25.22 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.8 
 
 		 587 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  23.03 
 
 		 1042 aa  74.7  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.8 
 
 		 587 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  21.96 
 
 		 914 aa  74.3  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004384  phosphate regulon sensor protein phoR  26.46 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1849  histidine kinase  27.04 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 587 aa  73.9  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.32 
 
 		 662 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  23.29 
 
 		 741 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.64 
 
 		 531 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 494 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01027  phosphate regulon sensor protein  26.11 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  28.39 
 
 		 300 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 307 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 494 aa  73.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  28.83 
 
 		 713 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 737 aa  73.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  22.43 
 
 		 708 aa  73.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  29.27 
 
 		 587 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.27 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  29.27 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  28.38 
 
 		 318 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  26.89 
 
 		 829 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  29.27 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  29.27 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  24.81 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 1029 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3565  histidine kinase  28.87 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  29.27 
 
 		 587 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 418 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 905 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 528 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 904 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.58 
 
 		 1131 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  25.57 
 
 		 910 aa  71.6  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  27.73 
 
 		 746 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  26.38 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>