More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004384 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004384  phosphate regulon sensor protein phoR  100 
 
 		 402 aa  827    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0254  phosphate regulon sensor protein  86.57 
 
 		 433 aa  715    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01027  phosphate regulon sensor protein  96.02 
 
 		 432 aa  758    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2456  phosphate regulon sensor protein  69.92 
 
 		 432 aa  591  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  62.34 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  59.7 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  60.1 
 
 		 438 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3275  phosphate regulon sensor protein  60.1 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  59.7 
 
 		 431 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  59.7 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  59.45 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.8 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  59.45 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  59.45 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  59.45 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0868  phosphate regulon sensor protein  58.96 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  59.45 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3135  phosphate regulon sensor protein  59.85 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0436  phosphate regulon sensor protein  59.2 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0497  phosphate regulon sensor protein  59.2 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0442  phosphate regulon sensor protein  59.2 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0455  phosphate regulon sensor protein  59.2 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0436  phosphate regulon sensor protein  58.96 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3105  phosphate regulon sensor protein  59.85 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2914  phosphate regulon sensor protein  59.7 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1009  phosphate regulon sensor protein  58.6 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  58.85 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.37 
 
 		 430 aa  441  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000859237  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2708  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.35 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000004963  decreased coverage  0.000000358257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.35 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1075  phosphate regulon sensor protein PhoR  54.5 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000451223  normal  0.527296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  52.62 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.87 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200806  hitchhiker  0.00000878354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.23 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2767  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00352447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.23 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.23 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.23 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.23 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.4 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3302  putative PAS/PAC sensor protein  52.01 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000529502  decreased coverage  0.00000000230896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03439  phosphate regulon sensor protein PhoR  51.49 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  52.64 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.55 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1054  histidine kinase  49.75 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2231  sensor histidine kinase  45.83 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0734871  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1209  phosphate regulon sensor protein PhoR  46.68 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48530  phosphate regulon histidine protein kinase; PhoR  48.48 
 
 		 440 aa  358  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.771609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 439 aa  348  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2400  Signal transduction histidine kinase, PhoR  45.97 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.595791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4407  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.146321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2471  Histidine kinase  43.28 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5033  PAS:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  46.29 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26034  normal  0.358942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 442 aa  330  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5607  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.825444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5321  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5478  phosphate regulon sensor protein phoR  46.04 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70760  two-component sensor PhoR  46.7 
 
 		 443 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6139  two-component sensor PhoR  46.29 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 440 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  42.89 
 
 		 430 aa  312  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4401  histidine kinase  39.58 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  37.91 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 443 aa  292  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  42.15 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  38.06 
 
 		 555 aa  280  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2267  histidine kinase  44.07 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0542  histidine kinase  38.69 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1922  signal transduction histidine kinase sensor  42.78 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2215  histidine kinase  43.11 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02493  two-component system sensor protein  43.15 
 
 		 442 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  39.34 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  39.78 
 
 		 437 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  39.13 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  39.94 
 
 		 448 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  39.94 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  39.94 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  40.22 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  39.94 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  39.94 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  39.94 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  39.94 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 454 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 437 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 439 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 439 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 468 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1535  phosphate regulon two-component sensor kinase transcription regulator protein  41.29 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.777366 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  37.08 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>