More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1256 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1256  histidine kinase  100 
 
 		 652 aa  1292    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 680 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 686 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  27.79 
 
 		 696 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 682 aa  147  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  26.92 
 
 		 795 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 		 802 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 662 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 686 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 662 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 662 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  26.86 
 
 		 698 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 		 602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 663 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  22.9 
 
 		 668 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  36.29 
 
 		 689 aa  113  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1098  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 633 aa  111  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0013981  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.33 
 
 		 531 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  26.94 
 
 		 614 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 679 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  37.12 
 
 		 529 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 535 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  26.88 
 
 		 914 aa  110  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  34.36 
 
 		 535 aa  108  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  30.89 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4322  histidine kinase  30.28 
 
 		 636 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.461598  normal  0.0714354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 405 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41190  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  27.71 
 
 		 796 aa  105  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.76 
 
 		 1045 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 694 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149051  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  22.37 
 
 		 1042 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 541 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 1124 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2670  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.54 
 
 		 1131 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 474 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 421 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0377  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 673 aa  99.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  20.84 
 
 		 708 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  23.29 
 
 		 677 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 816 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 387 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  32.35 
 
 		 1071 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  32.35 
 
 		 1071 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 510 aa  97.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 498 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 590 aa  96.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  38.1 
 
 		 425 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 487 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 564 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 440 aa  95.5  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 490 aa  95.1  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 445 aa  95.1  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 708 aa  95.1  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  30.59 
 
 		 586 aa  94.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 463 aa  93.6  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.31 
 
 		 397 aa  94  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  31.84 
 
 		 1153 aa  93.2  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  34.76 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 445 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5470  histidine kinase  27 
 
 		 467 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0102378  hitchhiker  0.00183313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 587 aa  93.6  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1753  histidine kinase  28.91 
 
 		 578 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 		 1113 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 1516 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 884 aa  92.4  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 458 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 514 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.21 
 
 		 656 aa  91.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 458 aa  91.3  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 1138 aa  91.3  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 448 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 1273 aa  90.9  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 1127 aa  90.9  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 448 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  32.57 
 
 		 448 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 467 aa  90.9  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 448 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 644 aa  90.9  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.04 
 
 		 496 aa  90.5  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 608 aa  90.5  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 462 aa  90.5  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  34.02 
 
 		 423 aa  90.1  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 1120 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 597 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  30.55 
 
 		 347 aa  90.1  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.41 
 
 		 490 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 584 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  31.42 
 
 		 454 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 449 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 604 aa  89.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 1011 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 460 aa  89  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>