68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1890 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 211 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  44.75 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  42.31 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  46.54 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  38.92 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  38.46 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  42.78 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  40.62 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  48.08 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  35.71 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  41.57 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.1 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  43.53 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  43.42 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  36.71 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  38.67 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1613  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  40.13 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  39.74 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  40 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  40 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  37.68 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  40 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  38.73 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  40 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  40.13 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  41.06 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  40.13 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  40.13 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  37.62 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  43.03 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  37.91 
 
 		 197 aa  121  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  37.25 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  39.62 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  39.2 
 
 		 244 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  40.46 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  41.86 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  39.22 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  36.47 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  39.77 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  40 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  39.52 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  38.01 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  34.76 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  35.37 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  39.18 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  29.21 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  27.98 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  24.75 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  32.72 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  29.9 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  29.56 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  30.27 
 
 		 321 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  30.09 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  39.51 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  37.18 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  35.71 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  34.21 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2554  2OG-Fe(II) oxygenase  28.03 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3466  2OG-Fe(II) oxygenase  28.32 
 
 		 306 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.413684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1127  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  28.83 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328998  decreased coverage  0.000557231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3024  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.25 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733.1  proline hydroxylase  31.37 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5157  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.63 
 
 		 309 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.838814  normal  0.639881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0949  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.37 
 
 		 237 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0923  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.37 
 
 		 238 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0957  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.37 
 
 		 238 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>