118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1580 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
144 aa  290  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  90.97 
 
 
144 aa  266  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  89.58 
 
 
144 aa  263  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  46.62 
 
 
149 aa  128  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  41.61 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  38.41 
 
 
147 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  44.23 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  46.53 
 
 
144 aa  94.4  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.62 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  36.79 
 
 
163 aa  88.6  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.28 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  35.9 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
115 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.75 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  34.86 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1559  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  34.51 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  34.51 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  45.31 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.28 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.68 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  41.18 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.86 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 
114 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  35.8 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  29.29 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.68 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.24 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.33 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.63 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  33.8 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  34.38 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  30.63 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  30.7 
 
 
134 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.24 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  32.35 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  30.39 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.79 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.79 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.1 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  51.22 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.92 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  30.63 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.66 
 
 
126 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.98 
 
 
114 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  28.72 
 
 
175 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  29.85 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  31.18 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.61 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.78 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  26.19 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  26.19 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.21 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  29.79 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.67 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  36.92 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  36.92 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.44 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  31.91 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  41.82 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.27 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  39.68 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  32.89 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  32.89 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  28.87 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  28.41 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.81 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.23 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.46 
 
 
211 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1570  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.92 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  31.34 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.34 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.1 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.29 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1720  carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 
104 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0242433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  37.5 
 
 
98 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.9 
 
 
125 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1918  alkylhydroperoxidase  30.36 
 
 
121 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0017385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.51 
 
 
130 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.59 
 
 
135 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.36 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>