More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0582 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
374 aa  748    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  56.84 
 
 
378 aa  424  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  39.21 
 
 
395 aa  315  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  37.63 
 
 
396 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  37.73 
 
 
381 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 
386 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 
375 aa  273  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
377 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
379 aa  222  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  29.84 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  29.87 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
397 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  29.19 
 
 
358 aa  185  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
372 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  32.3 
 
 
384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
381 aa  179  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
382 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
358 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
666 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
388 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  27.27 
 
 
375 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
364 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  26.77 
 
 
374 aa  149  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
405 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
374 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
396 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
382 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
374 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  21.28 
 
 
393 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
392 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
366 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
401 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
366 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
360 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
385 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
355 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
536 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.38 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  21.16 
 
 
761 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.88 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  28.15 
 
 
650 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.49 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
507 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  22.1 
 
 
767 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  20.65 
 
 
789 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.41 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.12 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.63 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  26.6 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  23.18 
 
 
797 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
747 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  21.38 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  21.85 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  38.35 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>