132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0258 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  100 
 
 
317 aa  632  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  95.58 
 
 
317 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  90.54 
 
 
317 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  72.61 
 
 
319 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  51.06 
 
 
356 aa  270  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  32.9 
 
 
321 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  31.75 
 
 
327 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  32.51 
 
 
338 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  31.86 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  29.77 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  29.91 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  30 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  31.38 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  30.13 
 
 
316 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  29.24 
 
 
314 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  27.16 
 
 
314 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  27.08 
 
 
340 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  31.19 
 
 
314 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  30.57 
 
 
322 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  27.08 
 
 
340 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  30.65 
 
 
330 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  31.76 
 
 
328 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  27.51 
 
 
432 aa  97.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  28.21 
 
 
306 aa  96.3  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  32.99 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  25.93 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  29.1 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25.21 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  25.33 
 
 
349 aa  93.2  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  30.65 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  25.78 
 
 
314 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  28.19 
 
 
289 aa  89  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  29.79 
 
 
301 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  29.22 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  30.64 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  25.74 
 
 
316 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  29.64 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  29.64 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  26.4 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  26.4 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  27.71 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  26.1 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  27.04 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  32.39 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  27.34 
 
 
735 aa  76.3  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  29.56 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  26.4 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  24.31 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  24 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  24.45 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  27.11 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  24.38 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  26.59 
 
 
900 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  26.9 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  24.64 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  24.64 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  28.67 
 
 
306 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  23.35 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  22.59 
 
 
369 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  23.84 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.57 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  23.33 
 
 
414 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  22.87 
 
 
380 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  24.17 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  22.89 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  26.53 
 
 
400 aa  60.8  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  25.08 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  28.33 
 
 
276 aa  59.7  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  23.91 
 
 
399 aa  59.3  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  22.87 
 
 
355 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  23.6 
 
 
349 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  25.13 
 
 
490 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  25.75 
 
 
779 aa  56.2  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  22.22 
 
 
372 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  22.41 
 
 
380 aa  55.8  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  23.1 
 
 
383 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  27.54 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  25.3 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  26.26 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  25 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  22.29 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  20.49 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  21.94 
 
 
392 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  23.67 
 
 
350 aa  52.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  23.67 
 
 
350 aa  52.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  22.16 
 
 
405 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  22.44 
 
 
392 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  27.47 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  21.61 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  21.39 
 
 
416 aa  50.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  22.31 
 
 
391 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  21.01 
 
 
363 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  22.65 
 
 
391 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  25.37 
 
 
336 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  23.92 
 
 
385 aa  49.3  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  32.43 
 
 
323 aa  49.3  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  23.85 
 
 
384 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  24.58 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  28.57 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>