More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0219 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  81.68 
 
 
513 aa  891    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  95.32 
 
 
513 aa  1013    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1050    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  68.97 
 
 
511 aa  755    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  94.35 
 
 
513 aa  1006    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  53.94 
 
 
503 aa  569  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  51.96 
 
 
500 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  50.98 
 
 
500 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  49.9 
 
 
502 aa  521  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  49.42 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  47.95 
 
 
503 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  48.54 
 
 
502 aa  497  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  47.57 
 
 
502 aa  487  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  48.77 
 
 
399 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  52.91 
 
 
412 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  52.28 
 
 
407 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  49.14 
 
 
403 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  49.87 
 
 
390 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  49.37 
 
 
390 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  48.73 
 
 
406 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  48.48 
 
 
390 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  47.49 
 
 
421 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  47.07 
 
 
423 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  44.13 
 
 
438 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  44.7 
 
 
389 aa  346  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  44.44 
 
 
389 aa  342  9e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  44.64 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  46.57 
 
 
405 aa  335  9e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  43.12 
 
 
384 aa  333  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  43.15 
 
 
455 aa  332  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  42.24 
 
 
404 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  42.24 
 
 
404 aa  329  9e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  45.94 
 
 
408 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  45.18 
 
 
408 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  45.43 
 
 
408 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  42.57 
 
 
388 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  41.6 
 
 
390 aa  314  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  43.54 
 
 
434 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  33.23 
 
 
413 aa  148  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  30.38 
 
 
418 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  32.48 
 
 
414 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  28.44 
 
 
427 aa  127  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  29.43 
 
 
438 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  30.42 
 
 
408 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  29.08 
 
 
405 aa  120  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  30.77 
 
 
410 aa  114  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  44.44 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  32.54 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  30.98 
 
 
388 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  31.51 
 
 
388 aa  110  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  41.53 
 
 
490 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  42.02 
 
 
490 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  31.85 
 
 
388 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  40.34 
 
 
491 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  42.86 
 
 
579 aa  100  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  38.84 
 
 
496 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  45.92 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  38.52 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
225 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.82 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.61 
 
 
256 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
139 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  35.83 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  36.44 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  35.16 
 
 
220 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
223 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.3 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  27.73 
 
 
132 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.9 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  33.08 
 
 
137 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  33.05 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  33.05 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  33.05 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  30.15 
 
 
154 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 
133 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 
137 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
162 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
162 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.6 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  35.71 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  35.48 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  32.33 
 
 
137 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.45 
 
 
155 aa  67  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
152 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
262 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  30.95 
 
 
216 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
215 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.37 
 
 
490 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  32.74 
 
 
124 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
279 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  35.43 
 
 
300 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  27.73 
 
 
281 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
279 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.2 
 
 
845 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  29.57 
 
 
127 aa  64.7  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
279 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  28.19 
 
 
152 aa  64.3  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  35.59 
 
 
413 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 
216 aa  64.3  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>