147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0738 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  100 
 
 
269 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  47.86 
 
 
284 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  43.77 
 
 
251 aa  238  6.999999999999999e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  45.59 
 
 
252 aa  236  3e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  46.54 
 
 
281 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  43.24 
 
 
252 aa  218  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  44.84 
 
 
320 aa  218  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  41.46 
 
 
689 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  45.69 
 
 
262 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  41.9 
 
 
689 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  39.8 
 
 
298 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  45.21 
 
 
284 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  45.19 
 
 
688 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  43.06 
 
 
688 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  40.48 
 
 
298 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  41.26 
 
 
690 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  43.54 
 
 
269 aa  205  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  41.64 
 
 
297 aa  205  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  44.87 
 
 
256 aa  203  3e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  41.29 
 
 
302 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  38.95 
 
 
288 aa  202  6e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  43.48 
 
 
688 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  38.98 
 
 
297 aa  198  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  38.44 
 
 
297 aa  198  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  44.23 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  43.04 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  36.93 
 
 
285 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  43.64 
 
 
318 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  43.64 
 
 
295 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  40.6 
 
 
272 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  40.21 
 
 
687 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  42.68 
 
 
316 aa  186  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  43.64 
 
 
290 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  44.4 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  40.27 
 
 
289 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  39.58 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  42.86 
 
 
294 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  41.37 
 
 
271 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  41.1 
 
 
253 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  41.3 
 
 
269 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  37.9 
 
 
307 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  36.43 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  36.43 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  36.23 
 
 
450 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  36.5 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  35.69 
 
 
286 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  31.48 
 
 
277 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  36.4 
 
 
263 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  38.05 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  25.63 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  25.45 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  26.78 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  25.52 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  28.27 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  26.37 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  27.16 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.91 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  27.04 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  27.04 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  26.3 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  26.53 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  26.36 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  26.36 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  27.43 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  24.38 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  26.18 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  26.18 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  28.06 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  24.21 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  25.32 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  26.64 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  25.61 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  24.03 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  28.19 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  26.59 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  24.07 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  26.59 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  26.21 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  26.21 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  23.81 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  26.62 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  25.26 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  23.53 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  26.35 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  24.9 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  23.23 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  25.43 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  26.03 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  25.73 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.29 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3541  cytochrome c1  23.62 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2741  cytochrome c1  24.7 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0422  cytochrome c1  22.96 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674989  hitchhiker  0.0000052369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2664  cytochrome c1  22.96 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0443  cytochrome c1  22.96 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  24.83 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0370  cytochrome c1  23.83 
 
 
252 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0346  cytochrome c1  24.21 
 
 
252 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  23.83 
 
 
252 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57540  putative cytochrome c1 precursor  23.84 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>