More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0735 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0735  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.44981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2955  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.11 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649621  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2241  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.7 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103501  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.76 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806848  normal  0.241303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.37 
 
 
156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1346  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.16 
 
 
152 aa  160  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202952  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3216  tRNA/rRNA methyltransferase  50.68 
 
 
161 aa  156  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3047  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
153 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6224  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.35 
 
 
163 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0153  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.68 
 
 
179 aa  154  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7081  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.35 
 
 
154 aa  153  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2171  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
153 aa  151  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2783  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.26 
 
 
153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.482099  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0923  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.65 
 
 
162 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0645  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.68 
 
 
149 aa  150  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  0.580297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1203  tRNA/rRNA methyltransferase  50.68 
 
 
151 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0626663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1544  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.26 
 
 
153 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  normal  0.0718657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.26 
 
 
160 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2299  putative tRNA/rRNA methyltransferase  50 
 
 
158 aa  147  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.727719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0666  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.65 
 
 
149 aa  147  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4629  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 
176 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.998464  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.97 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.0166669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1199  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.89 
 
 
150 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.565462  normal  0.954982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1301  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.58 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.84 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236894  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1005  RNA methyltransferase  42.57 
 
 
155 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1495  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1546  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.26 
 
 
151 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3242  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.38 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3802  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.98 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.74 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106137  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1241  RNA methyltransferase TrmH, group 2  41.61 
 
 
183 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.67 
 
 
156 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  40.14 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0874  RNA methyltransferase  40.67 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.33 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0939  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  36.94 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3815  RNA methyltransferase  40.67 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4609  TrmA family RNA methyltransferase  38.51 
 
 
153 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00112922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  39.33 
 
 
156 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10001  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  36.31 
 
 
160 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.437921  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  39.19 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09981  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  35.03 
 
 
160 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.582415  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
156 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3201  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
156 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0668  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
156 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
156 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0485  RNA methyltransferase  39.19 
 
 
179 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
156 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  39.19 
 
 
179 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.45 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.84 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.451539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1836  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.6 
 
 
152 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  38.78 
 
 
149 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  40.79 
 
 
151 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  37.33 
 
 
154 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06670  predicted rRNA methylase SpoU family  42.67 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.728557  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  37.84 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  37.33 
 
 
156 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  38.93 
 
 
155 aa  110  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  41.33 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  37.33 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0422  RNA methyltransferase  38 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2460  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.31 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000877061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0238  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.81 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.460006  normal  0.0379576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  39.74 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  39.33 
 
 
157 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1943  RNA methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0233  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  36.49 
 
 
156 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0188294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  39.33 
 
 
153 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  38.67 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2736  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.61 
 
 
155 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.372982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3194  RNA methyltransferase TrmH, group 2  35.81 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00355106  hitchhiker  0.0000259155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3185  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  38.51 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  37.84 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2851  RNA methyltransferase  37.16 
 
 
172 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  39.74 
 
 
153 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2721  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.4 
 
 
160 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.647154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  34.67 
 
 
156 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2141  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.26 
 
 
160 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0358  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  35.33 
 
 
156 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3910  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.33 
 
 
158 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  42.28 
 
 
154 aa  104  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1648  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  32.67 
 
 
156 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158148  normal  0.993753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  37.33 
 
 
153 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2237  RNA methyltransferase TrmH, group 2  37.76 
 
 
168 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1528  RNA methyltransferase  39.86 
 
 
152 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.26 
 
 
157 aa  103  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  40.67 
 
 
154 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  34 
 
 
156 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22350  predicted rRNA methylase SpoU family  40.79 
 
 
158 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125418  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  34.46 
 
 
152 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  34.46 
 
 
152 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0473  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.6 
 
 
186 aa  100  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0834  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.49 
 
 
152 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0618819 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  35.1 
 
 
171 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>