More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0473 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0473  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0383  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  70.89 
 
 		 168 aa  221  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06670  predicted rRNA methylase SpoU family  69.28 
 
 		 157 aa  221  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.728557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0968  hypothetical protein  61.04 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.815301  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1170  putative RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  59.01 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0394507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2460  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.16 
 
 		 155 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000877061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2736  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.18 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.372982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3003  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.47 
 
 		 153 aa  188  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1533  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.6 
 
 		 154 aa  188  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401176  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16300  predicted rRNA methylase SpoU family  58.78 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.292915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4891  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.21 
 
 		 154 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.723752  normal  0.0326205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13402  tRNA/rRNA methylase spoU  60.26 
 
 		 154 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853607  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1213  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.67 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1186  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.67 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1203  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.67 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.785783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1754  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.81 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.698666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2282  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.75 
 
 		 167 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0939  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.62 
 
 		 154 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22350  predicted rRNA methylase SpoU family  57.43 
 
 		 158 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.4 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  52 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  47.68 
 
 		 154 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14890  rRNA methylase, putative, group 2  59.15 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 		 154 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  52.29 
 
 		 156 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  47.3 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.94 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0233  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.67 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0188294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.65 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.02 
 
 		 156 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  46.62 
 
 		 153 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  46.62 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50.98 
 
 		 156 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  46.62 
 
 		 153 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0358  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  49.67 
 
 		 156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.27 
 
 		 151 aa  151  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50.98 
 
 		 156 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0485  RNA methyltransferase  51.63 
 
 		 179 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3201  RNA methyltransferase  51.63 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0668  RNA methyltransferase  51.63 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  51.63 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  51.63 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  51.63 
 
 		 179 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  51.63 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.59 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  47.97 
 
 		 159 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0422  RNA methyltransferase  51.63 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0257  RNA methyltransferase TrmH, group 2  49.67 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1538  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.47 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  47.97 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3185  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  52 
 
 		 161 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  50.33 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  46.05 
 
 		 154 aa  147  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.65 
 
 		 157 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0879  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.62 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  46.05 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1000  tRNA/rRNA methylase  46.62 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.62 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.3 
 
 		 151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.36 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  53.06 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  53.06 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  45.95 
 
 		 153 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  45.27 
 
 		 154 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.95 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.62 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.97 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.67 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.451539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  46.62 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  44.08 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00538  putative tRNA/rRNA methyltransferase  47.62 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.62 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  45.27 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  46.62 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  44.44 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  44.74 
 
 		 154 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  44.74 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  44.08 
 
 		 154 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1943  RNA methyltransferase  45.75 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  44.74 
 
 		 154 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  46.05 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0874  RNA methyltransferase  48 
 
 		 159 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  44.74 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.39 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.05 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.39 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3202  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.98 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.05 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  45.95 
 
 		 154 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  46.71 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0052  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.03 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.95 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.95 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.47 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.675577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1241  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.05 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.27 
 
 		 157 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  45.52 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0973  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.2 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>